在另一个数据帧上执行UDF时,如何引用pyspark数据帧?
这是一个虚拟的例子。我正在创建两个数据框scores
和lastnames
,并且每个数据框中都有一列在两个数据框架中相同的列。在scores
上应用的UDF中,我想过滤lastnames
并返回lastname
中找到的字符串。
from pyspark import SparkContext
from pyspark import SparkConf
from pyspark.sql import SQLContext
from pyspark.sql.types import *
sc = SparkContext("local")
sqlCtx = SQLContext(sc)
# Generate Random Data
import itertools
import random
student_ids = ['student1', 'student2', 'student3']
subjects = ['Math', 'Biology', 'Chemistry', 'Physics']
random.seed(1)
data = []
for (student_id, subject) in itertools.product(student_ids, subjects):
data.append((student_id, subject, random.randint(0, 100)))
from pyspark.sql.types import StructType, StructField, IntegerType, StringType
schema = StructType([
StructField("student_id", StringType(), nullable=False),
StructField("subject", StringType(), nullable=False),
StructField("score", IntegerType(), nullable=False)
])
# Create DataFrame
rdd = sc.parallelize(data)
scores = sqlCtx.createDataFrame(rdd, schema)
# create another dataframe
last_name = ["Granger", "Weasley", "Potter"]
data2 = []
for i in range(len(student_ids)):
data2.append((student_ids[i], last_name[i]))
schema = StructType([
StructField("student_id", StringType(), nullable=False),
StructField("last_name", StringType(), nullable=False)
])
rdd = sc.parallelize(data2)
lastnames = sqlCtx.createDataFrame(rdd, schema)
scores.show()
lastnames.show()
from pyspark.sql.functions import udf
def getLastName(sid):
tmp_df = lastnames.filter(lastnames.student_id == sid)
return tmp_df.last_name
getLastName_udf = udf(getLastName, StringType())
scores.withColumn("last_name", getLastName_udf("student_id")).show(10)
以下是跟踪的最后一部分:
Py4JError: An error occurred while calling o114.__getnewargs__. Trace:
py4j.Py4JException: Method __getnewargs__([]) does not exist
at py4j.reflection.ReflectionEngine.getMethod(ReflectionEngine.java:335)
at py4j.reflection.ReflectionEngine.getMethod(ReflectionEngine.java:344)
at py4j.Gateway.invoke(Gateway.java:252)
at py4j.commands.AbstractCommand.invokeMethod(AbstractCommand.java:133)
at py4j.commands.CallCommand.execute(CallCommand.java:79)
at py4j.GatewayConnection.run(GatewayConnection.java:209)
at java.lang.Thread.run(Thread.java:745)
答案 0 :(得分:6)
您无法直接从UDF内部引用数据帧(或RDD)。 DataFrame对象是驱动程序的句柄,spark用于表示将在集群上发生的数据和操作。在Spark选择的时候,UDF中的代码将在群集上耗尽。 Spark通过序列化该代码并复制包含在闭包中的任何变量并将它们发送给每个worker来完成此操作。
您想要做的是使用Spark在其中提供的构造来加入/组合两个DataFrame。如果其中一个数据集很小,您可以手动发送广播变量中的数据,然后从UDF访问它。否则,您可以像创建一样创建两个数据帧,然后使用连接操作来组合它们。这样的事情应该有效:
joined = scores.withColumnRenamed("student_id", "join_id")
joined = joined.join(lastnames, joined.join_id == lastnames.student_id)\
.drop("join_id")
joined.show()
+---------+-----+----------+---------+
| subject|score|student_id|last_name|
+---------+-----+----------+---------+
| Math| 13| student1| Granger|
| Biology| 85| student1| Granger|
|Chemistry| 77| student1| Granger|
| Physics| 25| student1| Granger|
| Math| 50| student2| Weasley|
| Biology| 45| student2| Weasley|
|Chemistry| 65| student2| Weasley|
| Physics| 79| student2| Weasley|
| Math| 9| student3| Potter|
| Biology| 2| student3| Potter|
|Chemistry| 84| student3| Potter|
| Physics| 43| student3| Potter|
+---------+-----+----------+---------+
值得注意的是,在引擎盖下Spark DataFrames有一个优化,其中作为连接一部分的DataFrame可以转换为广播变量,以避免在足够小的情况下进行随机播放。因此,如果您执行上面列出的连接方法,您应该获得最佳性能,而不会牺牲处理更大数据集的能力。
答案 1 :(得分:3)
将对更改为字典以便于查找名称
data2 = {}
for i in range(len(student_ids)):
data2[student_ids[i]] = last_name[i]
而不是创建rdd
并使其成为df
创建广播变量
//rdd = sc.parallelize(data2)
//lastnames = sqlCtx.createDataFrame(rdd, schema)
lastnames = sc.broadcast(data2)
现在使用广播变量values
上的lastnames
attr在udf中访问此内容。
from pyspark.sql.functions import udf
def getLastName(sid):
return lastnames.value[sid]