脚本无法提交给SGE,立即提交给Eqw,没有stdout / stderr

时间:2016-12-12 14:50:22

标签: nfs hpc sungridengine

我向SGE提交了一些非常简单的脚本(~103),它们都使用相同的工作目录。

#!/bin/bash
echo $MYVAR

当逐个运行时,它们都会成功执行。当我提交了大约约30个提交的工作时,其中一些工作未能提交并立即进入Eqw州。当我用qstat -j $jobid -explain E检查qstatus时,状态如下。

sge_o_shell:                 /bin/bash
sge_o_workdir:               /home/myname/some/common/path
sge_o_host:                  hostly
notify:                      FALSE
job_name:                    scriptXXXXXXXXXXXXXXXXXX.sh
jobshare:                    0
shell_list:                  NONE:/bin/bash
env_list:                    
mail_list                    myname@hostly.example.com
error reason    1:           12/07/2016 11:14:58 [123456:123456]: error: can't chdir to /home/myname/some/common
scheduling info:             Job is in error state

我使用NFS挂载的主目录作为SGE的通用工作目录。该目录存在并且已经包含文件。它没有提到正常的can't chdir to $PATH; file or directory does not exist,只是说它不能chdir到父目录。这很可能是NFS问题吗?

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