R.中的read.gct函数哪个包将支持R中的函数read.gct(“文件路径”)。如何读取R中的gct文件

时间:2016-12-11 13:21:30

标签: r

我有一个gct文件,我想在R中读取基因表达分析。但是没有识别read.gct(“文件路径”)。 我需要一个支持该功能的包。如果是,那么所谓的包是什么。感谢

2 个答案:

答案 0 :(得分:0)

R包Cmapr 检查github:https://github.com/cmap/cmapR/

答案 1 :(得分:0)

该线程稍旧。无论如何,另一种解决方案是使用read.table()而不需要任何其他库。 GCT文件只是纯文本文件。只需跳过标题行即可:

dat.gct <- read.delim(file="GTEx_Analysis.gct.gz", skip=2)