我有一个gct文件,我想在R中读取基因表达分析。但是没有识别read.gct(“文件路径”)。 我需要一个支持该功能的包。如果是,那么所谓的包是什么。感谢
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R包Cmapr 检查github:https://github.com/cmap/cmapR/
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该线程稍旧。无论如何,另一种解决方案是使用read.table()而不需要任何其他库。 GCT文件只是纯文本文件。只需跳过标题行即可:
dat.gct <- read.delim(file="GTEx_Analysis.gct.gz", skip=2)