Question

我用bnlearn构建了一个网络，但是有一些节点没有边缘到另一个节点，所以我想删除它们。是否有命令从bn对象中删除特定节点？

Answer 1

bnlearn内置了arc operations（文档也here）。这些函数还具有检查图中循环的好处，因为贝叶斯网络需要是非循环的（有向无环图或DAG），否则会得到无限循环而无法计算条件概率。还有一个check.illegal参数，用于在添加弧时检查另一个违反模型的行为（请参阅文档）。

但是，他们的例子不是很好，文档也不是。操作返回一个模型，因此您必须使用返回的模型覆盖旧模型。

data(learning.test)
# model ends up the same every time here, but may want
# to set random seed for reproducibility in other cases
set.seed(42)
model = tabu(learning.test)  # tabu is a better algo than hc I think
plot(model)

model <- set.arc(model, "A", "F")
plot(model)
model <- drop.arc(model, "A", "F")
plot(model)

set.edge设置无向边，而set.arc设置有向边。

Answer 2

所以我的尝试就是使用modelstring功能。获取字符串，删除我知道它没有任何弧/边的节点 - 我手动执行 - 保存到新的修改后的字符串，然后使用命令model2network再次将字符串转换为网络。这是命令序列：

model.string <- modelstring(mymodel)
model.string
new.string <- "your string except the node you want to remove from the output above"
new.model <- model2network(new.string)

我想如果你总共没有很多节点（我已经有22个）并且你只想从列表中删除一些节点，那就行了。

希望有所帮助！

Answer 3

Fabiola的回答对我很有帮助。

这是一种做同样的方法，但无需手动更改模型字符串。

这是我第一次回答问题，因此，关于格式，请放轻松。

＆＃34;净＆＃34;是我的网络，＆＃34; TARGET_NODE＆＃34;是我想要预测的节点（我将其包括在列表中以确保我不会删除它）和＆＃34; uniq＆＃34;我的数据集。

model.string <- modelstring(net)
final_nodes <- unique(c(unlist(list(net$arcs)), TARGET_NODE))
nodes_to_delete <- paste("\\[",setdiff(names(net$nodes), final_nodes),"]", sep = "")
for (i in 1:length(nodes_to_delete)) {model.string <- gsub(nodes_to_delete[i], "", model.string)}
net <- model2network(model.string)

cols <- c(match(final_nodes, names(uniq)))
uniq <- uniq[,cols]

使用bnlearn包从贝叶斯网络中删除节点

3 个答案: