Question

我想使用python进行一些计算，并将数组数据放到r中以得到一些图。

对于1-dim数组，我可以使用FloatVector来获得正确的答案，但是n-dim数组错误

（运行以下代码）

（2-dim array）
import numpy as np from rpy2.robjects.vectors import FloatVector x = np.array([[1, 2], [3, 4]]) X = FloatVector(x)

错误信息：

`Traceback (most recent call last):
 File "<stdin>", line 1, in <module>
 File "D:\Program\Anaconda3\lib\site-packages\rpy2\robjects\vectors.py",   line 456, in __init__
 obj = FloatSexpVector(obj)
 ValueError: Error while trying to convert element 0 to a double.`

使用numpy2ri可能会在某些绘图顺序中产生错误（例如ggplot2）

我想在spyder中完成所有这些。

Answer 1

转换机制可以是你的朋友：

from rpy2.robjects.conversion import localconverter
from rpy2.robjects import numpy2ri

with localconverter(numpy2ri.converter) as cv:
    X = cv.py2ro(x) # convert from *py*thon to *ro*bjects

否则，这种情况正在发生，因为rpy2正在尝试迭代序列x（没有与numpy交互的默认行为请求）并通过迭代使每个元素成为R / rpy2对象。这里它不起作用，因为x[i]转为FloatVector而你不能拥有FloatVector个FloatVector元素（你可以拥有一个FloatVector列表）。显然，这就是正在发生的事情（并且你会触发相同的错误）：

FloatVector([FloatVector(y) for y in x])

如何使用rpy2从python中获取n-dim数组

1 个答案: