Question

我是R的新手。我试图使用pca和ggbiplot来显示pca结果，但不知何故遇到了一些我无法解决的错误。也许我的数据存在问题，因为代码可以与其他数据一起使用。我把我使用的代码和数据文件放在以下链接中重新创建场景： -

https://drive.google.com/drive/folders/0B2jQ7Vh3S3PaZkt3Y2ZyaV9XaXc

代码：pca-plot.R 数据文件1：dat1.rda（这个工作正常）数据文件2：dat2.rda（这个有问题）

感谢任何帮助。我得到的错误在底部。

谢谢你， - 我们

> g <- ggbiplot(tr.pca, obs.scale = 1, var.scale = 1, 
+               groups = Ydfall, 
+               ellipse = TRUE, 
+               circle = TRUE)
Error in `$<-.data.frame`(`*tmp*`, "groups", value = c(1L, 1L, 1L, 1L,  : 
  replacement has 36 rows, data has 35
> g <- g + scale_color_discrete(name = '')
Scale for 'colour' is already present. Adding another scale for 'colour',     which will replace the existing scale.
> g <- g + theme(legend.direction = 'horizontal', 
+                legend.position = 'top')
> g<- g+ geom_point(size=1, shape=1, color="black", stroke=2)  
> 
> print(g)
>

Answer 1

来自dfall的{{1}} dat2.rda NA（尝试which(is.na(dfall), arr.ind = T)），这会导致您的问题。您在使用na.omit()时使用了prcomp()，但在使用Ydfall时未使用Ydfall <- na.omit(dfall)[,1] # quick fix # but if I were you, I would do first; dfall <- na.omit(dfall)。

{{ ansible_all_ipv4_addresses }}

R pca ggbiplot错误：替换有36行，数据有35行

1 个答案: