我正在尝试从sys.stdin获取输入。这是hadoop的map reducer程序。输入文件采用txt格式。预览数据集:
196 242 3 881250949
186 302 3 891717742
22 377 1 878887116
244 51 2 880606923
166 346 1 886397596
298 474 4 884182806
115 265 2 881171488
253 465 5 891628467
305 451 3 886324817
6 86 3 883603013
62 257 2 879372434
286 1014 5 879781125
200 222 5 876042340
210 40 3 891035994
224 29 3 888104457
303 785 3 879485318
122 387 5 879270459
194 274 2 879539794
291 1042 4 874834944
我一直在尝试的代码 -
import sys
df = pd.read_csv(sys.stdin,error_bad_lines=False)
我也试过delimiter = \t, header=False,defining column name
似乎没有什么工作,我得到的错误就是这个错误:
[root@sandbox lab]# cat /root/lab/u.data | python /root/lab/mid-1-mapper.py |python /root/lab/mid-1-reducer.py
Traceback (most recent call last):
File "/root/lab/mid-1-reducer.py", line 8, in <module>
df = pd.read_csv(sys.stdin,delimiter='\t')
File "/opt/rh/python27/root/usr/lib64/python2.7/site-packages/pandas/io/parsers.py", line 645, in parser_f
return _read(filepath_or_buffer, kwds)
File "/opt/rh/python27/root/usr/lib64/python2.7/site-packages/pandas/io/parsers.py", line 388, in _read
parser = TextFileReader(filepath_or_buffer, **kwds)
File "/opt/rh/python27/root/usr/lib64/python2.7/site-packages/pandas/io/parsers.py", line 729, in __init__
self._make_engine(self.engine)
File "/opt/rh/python27/root/usr/lib64/python2.7/site-packages/pandas/io/parsers.py", line 922, in _make_engine
self._engine = CParserWrapper(self.f, **self.options)
File "/opt/rh/python27/root/usr/lib64/python2.7/site-packages/pandas/io/parsers.py", line 1389, in __init__
self._reader = _parser.TextReader(src, **kwds)
File "pandas/parser.pyx", line 538, in pandas.parser.TextReader.__cinit__ (pandas/parser.c:5896)
pandas.io.common.EmptyDataError: No columns to parse from file
但是,如果我直接在python中尝试这个(不是在hadoop中),它可以正常工作。
我试图查看stackoverflow帖子,其中一个帖子建议尝试和除外。应用它会留下一个空文件。 有人可以帮忙吗?感谢
答案 0 :(得分:6)
使用try和except只是让你继续尽管有错误并处理它们。它不会神奇地修复你的错误。
csv
期待pandas.read_csv(filepath_or_buffer, delim_whitespace=True).
个文件,您的输入显然不是。快速浏览一下文档:
delim_whitespace:布尔值,默认为False
指定是否将空格(例如&#39;&#39;或#39;&#39;)用作sep。相当于设置sep =&#39; + s&#39;。如果此选项设置为True,则不应为delimiter参数传递任何内容。
这似乎是正确的论点。使用
delimiter='\t'
使用delim_whitespace
也应该有效,除非扩展选项卡(替换为空格)。我们无法确切地说,sys.stdin
似乎是更好的选择。
如果这没有帮助,只需打印出cat /root/lab/u.data | python /root/lab/mid-1-mapper.py |python /root/lab/mid-1-reducer.py
即可检查是否正确传递了文字。
编辑: 我刚刚看到你使用
mid-1-reducer.py
这是有意的,这样mid-1-mapper.py
处理u.data
的输出。如果您要处理文件sys.stdin
的内容,请考虑阅读该文件,而不是int
。
答案 1 :(得分:1)
您必须将delim_whitespace
设置为True,才能使用空格作为分隔符。
import sys
import pandas as pd
if __name__ == '__main__':
df = pd.read_csv(sys.stdin, header=None, delim_whitespace=True)
print df