Question

我目前正在进行MD模拟。它将分子位置存储在载体中。对于每个时间步，存储该向量以在第二个向量中显示，得到

std::vector<std::vector<molecule> > data;

data的大小为time steps*<number of molecules>*sizeof(molecule)，其中sizeof（分子）是（已经减少）3*sizeof(double)，作为位置向量。对于更大量的时间步长和分子数量，我仍然会遇到记忆问题。

因此，还有可能减少数据量吗？我目前的工作流程是我首先计算所有分子，存储它们，然后通过使用每个分子的每个分子的数据来渲染它们，渲染用Irrlicht完成。（也许稍后会用搅拌机）。

Answer 1

如果轨迹平滑，您可以考虑通过仅存储每第N步并通过插值恢复中间位置来压缩数据。

如果时间步长很小，则可以进行线性插值。顶级质量可以通过三次样条提供。无论如何，样条系数的计算是一个全局操作，您只能在最后执行并且需要额外的存储（！），您可能更喜欢可以从四个连续位置本地构建的基数样条。

Answer 2

通过以单精度而不是双精度存储位置，您可以获得2倍的改进 - 如果不是模拟，它将足以进行渲染。

但最终您需要将结果存储在文件中并脱机呈现。