我已经在非常强大的服务器上使用ete2模块一段时间了。
一切都很好,直到它开始变得非常缓慢(每分钟一个get_taxid_translator()
个功能),现在我甚至无法通过ncbi = NCBITaxa()
任务。
我已经卸载并重新安装了anaconda2,尝试更新到ete3,在我们的“开发服务器”上一切正常,但仍然无法通过普通服务器上的任何软件中的ncbi = NCBITaxa()
行。甚至以下脚本也无法完成
#!/usr/bin/env python
from ete3 import NCBITaxa
ncbi = NCBITaxa()
print "Finished"
这是否发生在其他人身上?我是否需要降级任何依赖项?这可能是权限问题吗?
当我运行基本脚本ctrl + c时,ctrl + z将转义脚本,我必须使用kill -9 <job-id>
来终止脚本。如果我等待太久,这个过程会进入不间断的睡眠状态。
提前谢谢你, 亚历。
Python 2.7.12 :: Anaconda custom(64位) gcc(GCC)5.4.0