Question

我尝试了stackoverflow中的一些选项（例如1）但是这也没有用，所以我的代码可能有错：

 fileConn<-file("outputR.txt")
for (i in 1:length(lines)){
  line = lines[i]
  fields = strsplit(line, "\t")[[1]]
  id = fields[1]
  goIDs = fields[2:length(fields)]
  list = as.list(GOCCANCESTOR[goIDs])
  text = paste(toString(id), ":", toString(goIDs))
  cat(text, file=fileConn, append=TRUE, sep = "\n")

}
close(fileConn)

当我运行此代码时，它会一直覆盖outputR.txt文件中的数据。有什么建议可以解决这个问题吗？

Answer 1

问题是你正在使用Fileconnection与cat结合使用，然后附加功能无法正常工作。你可以使用几个选项，最容易的就是这个：
首先＆＃34;创造＆＃34;该文件，如果您想添加标题，例如：

header = "some header" 
## if you don't want to use a header then leave the header blank
header =""
cat(text, file="outputR.txt", append=FALSE, sep = "\n")

如果要清除文件（如果已存在），请注意append = FALSE这是必要的，否则您必须使用append = TRUE
您可以使用以下方式将文字写入其中：

text = text = paste(toString(id), ":", toString(goIDs))
cat(text file="outputR.txt", append=TRUE, sep = "\n")

Answer 2

作为猫状态的帮助页面：

追加：逻辑。仅在参数文件是文件名（而不是连接或“| cmd”）时使用。如果TRUE输出将附加到文件;否则，它将覆盖文件的内容。

因此，如果在file参数中使用连接，则忽略append参数的值。

只需将文件参数指定为文件名：

cat(text, file="outputR.txt", append=TRUE, sep = "\n")

或者您可以使用指定的正确模式打开文件连接

w+ - 开放阅读和写作，最初截断文件。

fileConn <- file("outputR.txt", open = "w+")
for (i in 1:length(lines)){
  text <- paste("my text in line", i)
  cat(text, file = fileConn, sep = "\n")
}
close(fileConn)

Answer 3

这里有两个选项：

<强> 1 以写入模式打开文件：

lines <- c("aaaaa", "bbbb")


fileConn<-file("test.txt", "w")
for (i in 1:length(lines)){
  line = lines[i]
  cat(line, file=fileConn, append=TRUE, sep = "\n")
}
close(fileConn)

<强> 2 将write函数与append参数一起使用：

lines <- c("aaaaa", "bbbb")

for (i in 1:length(lines)){
  line = lines[i]
  write(line,file="test2",append=TRUE)  
}

R不会将行附加到文件（使用Cat或Write）

3 个答案: