我尝试使用heatmap
' ggplot
生成geom_tile
图。我的数据行数多于列数。
set.seed(1)
df <- data.frame(val=rnorm(100),gene=rep(letters[1:20],5),cell=c(sapply(LETTERS[1:5],function(l) rep(l,20))))
运行:
library(ggplot2)
ggplot(df,aes(y=gene,x=cell,fill=val))+geom_tile(color="white")
如何让heatmap
单元格具有对称尺寸 - 正方形而不是矩形(高度=宽度)?不会扭曲图形的尺寸。
答案 0 :(得分:10)
选项是添加coord_equal
。
默认值,ratio = 1,确保x轴上的一个单位是 与y轴上的一个单位相同的长度
ggplot(df, aes(y = gene, x = cell, fill = val)) +
geom_tile(color = "white") +
coord_equal()
答案 1 :(得分:3)