我有一个网格化的气候数据集,例如:
# generate time vector
time1 <- seq(14847.5,14974.5, by = 1)
time2 <- seq(14947.5,14974.5, by = 1)
time <- c(time1,time2)
time <- as.POSIXct(time*86400,origin='1970-01-01 00:00')
# generate lat and lon coordinates
lat <- seq(80,90, by = 1)
lon <- seq(20,30, by = 1)
# generate 3dimensional array
dat <- array(runif(length(lat)*length(lon)*length(time)),
dim = c(length(lon),length(lat),length(time)))
这样
> dim(dat)
[1] 11 11 156
数据的维度描述了不同经度(dim = 1
),纬度(dim = 2
)和时间(dim = 3
)的变量。
我目前的问题是有些时候会重复出现,这与测量数据的重叠传感器有关。因此,我想知道是否有可能只保留dat
的唯一时间,但是对于重复的时间平均网格内的数据,即如果有两个重复的天数,我们取每个纬度和经度的平均值当时的网格。
我可以找到独特的时间:
# only select unique times
new_time <- unique(time)
unique_time <- unique(time)
以下代码旨在遍历每个网格(lat
/ lon
)并平均所有重复日期。
# loop through lat/lon coordinates to generate new data
new_dat <- array(dim = c(length(lon),length(lat),length(new_time)))
for(i in 1:length(lon)){
for(ii in 1:length(lat)){
dat2 <- dat[i,ii,]
dat2b <- NA
for(k in 1:length(unique_time)){
idx <- time == unique_time[k]
dat2b[k] <- mean(dat2[idx], na.rm = TRUE)
}
new_dat[i,ii,] <- dat2b
}
}
我确信这提供了正确答案,但我确信有一种更清洁的方法可以实现这一目标。
我还应该注意到我的数据非常大(即k = 7000
),所以最后一个循环效率不高,至少可以说。
答案 0 :(得分:3)
我原来的回答:
使用dat2
:
dat2b
它仍然有3个循环中的2个,但它设法绕过创建unique_time
,f <- function(i, ii){as.numeric(aggregate(dat[i,ii,], by=list(time),mean)$x)}
for(i in 1:nrow(expand.grid(1:length(lon),1:length(lat)))){
new_dat[expand.grid(1:length(lon),1:length(lat))[i,1],
expand.grid(1:length(lon),1:length(lat))[i,2],] <-
f(expand.grid(1:length(lon),1:length(lat))[i,1],expand.grid(1:length(lon),
1:length(lat))[i,2])
}
和apply
。
我改进了答案:
{{1}}
归结为只有1个循环。我们可能会使用{{1}}绕过该循环。