随着更多顶点/边缘的添加,图形处理在titan + dynamoDB(局部)上越来越慢

时间:2016-09-02 15:36:28

标签: titan dynamo-local

我正在使用AWS dynamoDB本地实现的titan 1.0作为16GB机器上的存储后端。我的用例涉及生成周期性包含顶点和图形的图形。边缘大约120K。每当我在内存中生成一个新图形时,我会检查存储在DB中的图形,并且(i)添加不存在的顶点/边缘,或者(ii)更新属性(如果它们已经存在)(存在由&#39确定) ;标签'和'价值'属性)。请注意“价值”'财产已编入索引。事务以500个顶点批量提交。

问题:我发现每次处理新图表时此过程都会变慢(第一张图表最初在45分钟内完成,最初为空数据库,第二张图表耗时2.5小时,第三张图片耗时3.5小时,第4张6小时,10小时5分等等)。实际上,在处理给定图形时,它在启动时相当快,但逐渐变慢(初始批次需要2-4秒,之后对于相同批量大小的500个节点,它会增加到100秒;我有时也会看到它一批需要1000-2000秒。这仅是处理时间(见下面的方法);提交总是需要8-10秒。我将jvm堆大小配置为10G,我注意到当应用程序运行时,它最终会耗尽所有这些。

问题:这种行为是否可以预料到?在我看来这里有些问题(在我的config /方法中?)。任何帮助或建议将不胜感激。

方法:

  • 从内存中图的根节点开始,我检索所有子节点并维护队列
  • 对于每个子节点,我检查它是否存在于DB中,否则创建新节点,并更新一些属性

    Vertex dbVertex = dbgraph.traversal().V()
            .has(currentVertexInMem.label(), "Value",
                    (String) currentVertexInMem.value("Value"))
            .tryNext()
            .orElseGet(() -> createVertex(dbgraph, currentVertexInMem));
    
    if (dbVertex != null) {
        // Update Properties
        updateVertexProperties(dbgraph, currentVertexInMem, dbVertex);
    }
    
    // Add edge if necessary
    if (parentDBVertex != null) {
        GraphTraversal<Vertex, Edge> edgeIt = graph.traversal().V(parentDBVertex).outE()
                .has("EdgeProperty1", eProperty1) // eProperty1 is String input parameter
                .has("EdgeProperty2", eProperty2); // eProperty2 is Long input parameter
    
        Boolean doCreateEdge = true;
        Edge e = null;
        while (edgeIt.hasNext()) {
            e = edgeIt.next();
            if (e.inVertex().equals(dbVertex)) {
                doCreateEdge = false;
                break;
            }
    
        if (doCreateEdge) {
            e = parentDBVertex.addEdge("EdgeLabel", dbVertex, "EdgeProperty1", eProperty1, "EdgeProperty2", eProperty2);
        } 
        e = null;
        it = null;
    }
    
    ...
    
    if ((processedVertexCount.get() % 500 == 0) 
         || processedVertexCount.get() == verticesToProcess.get()) {                            
        graph.tx().commit();
    }
    

创建功能:

public static Vertex createVertex(Graph graph, Vertex clientVertex) {
    Vertex newVertex = null; 
    switch (clientVertex.label()) {
    case "Label 1":
        newVertex = graph.addVertex(T.label, clientVertex.label(), "Value",
                clientVertex.value("Value"), 
                "Property1-1", clientVertex.value("Property1-1"), 
                "Property1-2", clientVertex.value("Property1-2"));
        break;

    case "Label 2":
        newVertex = graph.addVertex(T.label, clientVertex.label(), "Value",
                clientVertex.value("Value"), "Property2-1",
                clientVertex.value("Property2-1"),
                "Property2-2", clientVertex.value("Property2-2"));
        break;

    default:
        newVertex = graph.addVertex(T.label, clientVertex.label(), "Value",
                clientVertex.value("Value"));
        break;
    }
    return newVertex;
}

架构默认:(显示部分索引)
注意:
   &#34; EdgeLabel&#34; = Constants.EdgeLabels.Uses
   &#34; EdgeProperty1&#34; = Constants.EdgePropertyKeys.EndpointId
   &#34; EdgeProperty2&#34; = Constants.EdgePropertyKeys.Timestamp

public void createSchema() {
    // Create Schema
    TitanManagement mgmt = dbgraph.openManagement();
    mgmt.set("cache.db-cache",true);

    // Vertex Properties
    PropertyKey value = mgmt.getPropertyKey(Constants.VertexPropertyKeys.Value);
    if (value == null) {
        value = mgmt.makePropertyKey(Constants.VertexPropertyKeys.Value).dataType(String.class).make();
        mgmt.buildIndex(Constants.GraphIndexes.ByValue, Vertex.class).addKey(value).buildCompositeIndex(); // INDEX
    }

    PropertyKey shapeSet = mgmt.getPropertyKey(Constants.VertexPropertyKeys.ShapeSet);
    if (shapeSet == null) {
        shapeSet = mgmt.makePropertyKey(Constants.VertexPropertyKeys.ShapeSet).dataType(String.class).cardinality(Cardinality.SET).make();
        mgmt.buildIndex(Constants.GraphIndexes.ByShape, Vertex.class).addKey(shapeSet).buildCompositeIndex();
    }
    ...

    // Edge Labels and Properties
    EdgeLabel uses = mgmt.getEdgeLabel(Constants.EdgeLabels.Uses);
    if (uses == null) {
        uses = mgmt.makeEdgeLabel(Constants.EdgeLabels.Uses).multiplicity(Multiplicity.MULTI).make();

        PropertyKey timestampE = mgmt.getPropertyKey(Constants.EdgePropertyKeys.Timestamp);
        if (timestampE == null) {
            timestampE = mgmt.makePropertyKey(Constants.EdgePropertyKeys.Timestamp).dataType(Long.class).make();
        }

        PropertyKey endpointIDE = mgmt.getPropertyKey(Constants.EdgePropertyKeys.EndpointId);
        if (endpointIDE == null) {
            endpointIDE = mgmt.makePropertyKey(Constants.EdgePropertyKeys.EndpointId).dataType(String.class).make();
        }

        // Indexes
        mgmt.buildEdgeIndex(uses, Constants.EdgeIndexes.ByEndpointIDAndTimestamp, Direction.BOTH, endpointIDE,
                timestampE);
    }

    mgmt.commit();
}

1 个答案:

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