我正在使用shp2pgsql将一个shapefile加载到一个postGIS数据库中,通过psql传输,包含在python子进程中,如下所示:
command = "shp2pgsql -s 4269 -a -D -W LATIN1 file.shp table | psql -h host -d db -U user"
p=subprocess.Popen(command, shell=True)
p.communicate()
这非常有效,输出如下:
Loading objects...
Shapefile type: Polygon
Postgis type: MULTIPOLYGON[2]
SET
SET
BEGIN
COMMIT
没有END
声明,但据我所知,END
和COMMIT
是等效的。
然后,我想将con.autocommit = True
设置为与同一数据库的psycopg2连接。我收到以下错误:
psycopg2.ProgrammingError: autocommit cannot be used inside a transaction
为什么psycopg2报告交易仍在进行中?我应该以不同的方式关闭psql事务吗?
如果我没有运行shp2pgsql子进程命令,con.autocommit
会成功执行。默认情况下shp2pgsql是否会在某处打开事务? (http://www.bostongis.com/pgsql2shp_shp2pgsql_quickguide.bqg不建议这样做)
pg_locks
中没有相关条目来建议停滞/空闲交易。我不在shp2pgsql函数中使用psycopg2连接对象。并且,如果我重新创建一个新的连接对象
con = psycopg2.connect(host=db_host, user=db_user, password=db_pass, database=db_name)
在shp2pgsql函数之后,con.autocommit=True
工作正常。
编辑:我当然可以在所有shp2pgsql导入完成后简单地创建psycopg2连接对象,但这在我的代码中并不理想,我宁愿了解发生了什么。
Edit2:打开psycopg2连接后立即设置con.autocommit=True
,而不是以后绕过此错误。
编辑3:添加MWE
import psycopg2
import os
import subprocess
from glob import glob
def vacuum(con, table=""):
autocommit_orig = con.autocommit
con.autocommit = True
with con.cursor() as cur:
cur.execute("VACUUM ANALYZE {};".format(table))
con.autocommit = autocommit_orig
def read_shapefile(path, tablename, srid="4269"):
command = "shp2pgsql -s {} -a -D -W LATIN1 {} {} | psql -h {} -d {} -U {}".format(srid, path, tablename, host, dbname, user)
p=subprocess.Popen(command, shell=True)
p.communicate()
def load_data(con, datapath):
dir = os.path.join(datapath,dataname)
shapefiles = glob(os.path.join(dir,"*.shp"))
for shapefile in shapefiles:
read_shapefile(shapefile, tablename)
if __name__ == "__main__":
con = psycopg2.connect(host=db_host, user=db_user, password=db_pass, database=db_name)
load_data(con, datapath)
vacuum(con, tablename)
答案 0 :(得分:0)
我无法看到这种情况发生在哪里,但根据this,this和this,事务会在第一次将命令发送到数据库时开始。
交易是按连接进行的,因此psql
不应该绊倒你。
关注this advice,我的建议是在代码中con.rollback()
之前加con.autocommit=True
。这将结束以某种方式开始的隐式事务。如果您仍然拥有所期望的所有数据,那么就会发出SELECT
命令或类似的只读指令。
如果您从con.rollback()
向后移动con.autocommit=True
,它将允许您在不重新构建代码的情况下隔离交易开始的位置。
这是一个猜测,但是当psql
更改数据库状态时,psycopg2可能会在那时开始一个事务?我没有找到支持这一假设的文档。
答案 1 :(得分:0)
只是添加一些我刚刚自己遇到类似问题时发现的额外信息...
我试图这样做:
conn = psycopg2.connect(DB_URL)
conn.autocommit = True
with conn, conn.cursor() as cur:
cur.execute("""
CREATE DATABASE mydb;
GRANT ALL PRIVILEGES ON DATABASE mydb TO myuser;
""")
但是我一直得到:
psycopg2.InternalError: CREATE DATABASE cannot run inside a transaction block
我尝试了各种方法:
conn = psycopg2.connect(DB_URL)
conn.autocommit = True
conn.set_session(autocommit=True)
conn.set_isolation_level(psycopg2.extensions.ISOLATION_LEVEL_AUTOCOMMIT)
...他们仍然给出了错误。
事实证明问题是试图同时执行两个语句。
这有效:
conn = psycopg2.connect(DB_URL)
conn.autocommit = True
with conn, conn.cursor() as cur:
cur.execute("CREATE DATABASE mydb")
cur.execute("GRANT ALL PRIVILEGES ON DATABASE mydb TO myuser")