如何使用ggplot2将标准误差条添加到框和胡须图？

Question

我试图在我的数据中添加标准错误栏，类似于在这个问题的答案末尾附近的方框图上看到的那些：https://stats.stackexchange.com/questions/8137/how-to-add-horizontal-lines-to-ggplot2-boxplot

我正在使用PlantGrowth数据集，它看起来像这样（除了总共30行之外）：

    weight    group
1   4.17      ctrl
2   5.58      ctrl
3   4.81      trt1
4   4.17      trt1
5   6.31      trt2
6   5.12      trt2

我制作了这个情节

使用以下代码

 ggplot(PlantGrowth, aes(group, weight))+
stat_boxplot(geom='errorbar', linetype=1, width=0.5)+  #whiskers
geom_boxplot(outlier.shape=1)+    
stat_summary(fun.y=mean, geom="point", size=2)   #dot for the mean

我不知道如何根据该因子变量中的变化为每个绘图添加误差条。我添加了+geom_errorbar(aes(x=group, ymin=mean-sd, ymax=mean+sd))但是它返回错误＆＃34;错误的意思是 - sd：非数字参数到二元运算符＆＃34;

任何帮助将不胜感激。谢谢

Answer 1

ggplot2中有一个mean_se函数，可以完全按照您的要求执行。

library(ggplot2)
ggplot(PlantGrowth, aes(group, weight))+
  stat_boxplot( aes(group, weight), 
    geom='errorbar', linetype=1, width=0.5)+  #whiskers
  geom_boxplot( aes(group, weight),outlier.shape=1) +    
  stat_summary(fun.y=mean, geom="point", size=2) + 
  stat_summary(fun.data = mean_se, geom = "errorbar")