当我尝试在激活跟踪系统的情况下运行某些COMPS应用程序时,出现以下错误:
libpapi.so.5.3.0.0 cannot open shared object file
我正在使用ubuntu,我已经使用apt-get从软件包中安装了COMPS。要启动我使用的应用程序:
runcompss --tracing --lang=python name_application.py
我已经安装了PAPI库:
apt-get install papi-tools libpapi-dev
编辑:我使用的是1.4版
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跟踪系统无法找到您的PAPI安装,因为软件包已预编译。
要解决此问题,您有两个选择:从源代码构建和安装跟踪包,或者从源代码构建和安装整个COMPS框架。建议的方法是构建整个框架,以确保安装干净。但是,如果您不想或不能安装完整的依赖项堆栈,则可以修补跟踪系统。
注意:说明假设安装目录为 / opt / COMPSs
构建所有框架(推荐)
确保先前的安装已完全删除
sudo apt-get remove compss-* (removes only packages)
sudo apt-get purge compss-* (removes also config files)
安装依赖项
sudo apt-get update
# Build dependencies
sudo apt-get -y --force-Yes install maven subversion
# Runtime dependencies
sudo apt-get -y --force-Yes install openjdk-8-jdk graphviz xdg-utils
# Bindings-common-dependencies
sudo apt-get -y --force-Yes install libtool automake build-essential
# Python-binding dependencies
sudo apt-get -y --force-Yes install python-dev
# C-binding dependencies
sudo apt-get -y --force-Yes install libxml2-dev libboost-serialization-dev libboost-iostreams-dev csh
# Extrae dependencies
sudo apt-get -y --force-Yes install libxml2 gfortran
下载来源:
svn co http://compss.bsc.es/svn/releases/compss/1.4
构建并安装
cd ./1.4/builders
sudo -E ./buildlocal /opt/COMPSs
仅构建和安装跟踪系统Extrae
删除以前的Extrae
sudo rm -r /opt/COMPSs/Dependencies/extrae
安装Extrae依赖项
# Extrae dependencies
sudo apt-get -y --force-Yes install libxml2 gfortran
下载来源:
svn co http://compss.bsc.es/svn/releases/compss/1.4
构建并安装extrae
cd ./1.4/dependencies/extrae/
sudo ./install /opt/COMPSs/Dependencies/extrae