Question

我想根据字符位值（用户指定）将字符串转换为相应的位向量。我正在处理基因组字符串，其中我只有4个字符，即A，G，C，T。我想用java中的以下位值来表示它们

A = 01
G = 11
C = 10
T = 00

现在给出一个字符串“AGGT”，那么它的相应比特值应该是01111100.我试过这样做：

 BitSet A = new BitSet(2);
 BitSet G = new BitSet(2);
 BitSet C = new BitSet(2);
 BitSet T = new BitSet(2);
 A.set(01);
 G.set(00);
 C.set(11);
 T.set(10);

String p = "AGGT";
BitSet bb = new BitSet();
for(int i = 0, n = p.length() ; i < n ; i++) { 
   bb.set(p.charAt(i))      
}

我做错了什么？如何以正确的方式做到这一点。？

Answer 1

正如@Thomas所指出的，BitSet.set(int)并不像你显然希望的那样工作。

public void set(int bitIndex)
将指定索引处的位设置为true。

所以：G.set(00)没有将G的两位设置为0：它将G的第二位（位置1）设置为{ {1}}。

但是你不能使用你最初创建的位集：如果在字符串中遇到true，你实际上是将第66位（位置65）设置为{{1} }，因为65是char文字A的整数值。

最简单的方法就是在循环中进行切换：

true

（将位设置为'A'并非必要;但它只是更明确一些。）

将字符串转换为java

1 个答案: