Question

我正在使用没有sudo访问权限的CentOS 6.8版（最终版）服务器。我编译了PostgreSQL v9.6 beta 2。

当我使用ant加载数据时，我得到 am.amcanorder列不存在错误，我不知道如何修复。

我正在按照教程设置Intermine数据仓库系统，我在this step。

 ant -Dsource=uniprot-malaria -v

这需要几分钟才能完成，命令会运行以下步骤：

检查project.xml中是否存在名为uniprot-malaria的来源
在src.data.dir
使用列表来调用uniprot源中包含的解析器文件，这将读取原始XML并创建其中的项目将加载到的对象的元数据表示疟原虫数据库。
这些项目存储在中间项目数据库中。阅读 items数据库，将项目转换为对象并将其加载到疟原虫数据库。

粗体部分是（在我看来）导致错误的部分。相关错误详见：

org.postgresql.util.PSQLException: ERROR: column am.amcanorder does not exist
  Position: 407
        at org.postgresql.core.v3.QueryExecutorImpl.receiveErrorResponse(QueryExecutorImpl.java:2161)
        at org.postgresql.core.v3.QueryExecutorImpl.processResults(QueryExecutorImpl.java:1890)
        at org.postgresql.core.v3.QueryExecutorImpl.execute(QueryExecutorImpl.java:255)
        at org.postgresql.jdbc2.AbstractJdbc2Statement.execute(AbstractJdbc2Statement.java:559)
        at org.postgresql.jdbc2.AbstractJdbc2Statement.executeWithFlags(AbstractJdbc2Statement.java:403)
        at org.postgresql.jdbc2.AbstractJdbc2Statement.executeQuery(AbstractJdbc2Statement.java:283)
        at org.postgresql.jdbc2.AbstractJdbc2DatabaseMetaData.getIndexInfo(AbstractJdbc2DatabaseMetaData.java:4234)
        at org.intermine.task.CreateIndexesTask.execute(CreateIndexesTask.java:212)
        at org.apache.tools.ant.UnknownElement.execute(UnknownElement.java:288)

Answer 1

Player87是正确的，只需用9.5。*的 PostgresSQL 服务器替换新版本9.6 *即可。但是，还有另一种解决方案。对于Java项目，我还尝试在9.6。*上保留 PostgresSQL 服务器，并更新了PostgresSQL驱动程序，从版本9.4-1203到最新的9.4-1211。在maven pom.xml文件中：

<postgresql.version>9.4.1211</postgresql.version>

这也适合我。

Answer 2

这个问题是通过编译v9.5.3来解决的，这是目前最新的稳定版本。以前，我使用的是v9.6beta2 ...在使用JDBC和amp;时使用reported error。 v9.6beta2。

Answer 3

对我来说（从Java / Maven应用程序连接到PostgreSQL并面临同样的错误）这是一个驱动程序问题。

将PostgreSQL驱动程序从9.4-1201-jdbc41更新到42.1.4解决了它。我的Maven依赖现在看起来像这样：

    <dependency>
        <groupId>org.postgresql</groupId>
        <artifactId>postgresql</artifactId>
        <version>42.1.4</version>
    </dependency>

Answer 4

我遇到了与SpringBoot相同的问题，并通过升级我的驱动程序解决了这个问题

对于Spring Boot 1.4.0，我刚刚添加了以下依赖项

<dependency> <groupId>org.postgresql</groupId> <artifactId>postgresql</artifactId> </dependency>

Answer 5

就我而言，我使用的是 PostgreSQL 驱动程序 (9.4.1204) 并且与 hive 外部元存储不兼容。替换为 https://jdbc.postgresql.org/download.html 的最新版本后工作。

PostgreSQL错误：列am.amcanorder不存在

5 个答案: