Question

我将一个csv文件加载到我的R中，当我尝试使用sqldf选择一些列时，它总是转到

Error in .local(drv, ...) : 
  Failed to connect to database: Error: Access denied for user 
  'User'@'localhost' (using password: NO)
Error in !dbPreExists : invalid argument type

我不知道如何修复它。

这是我的剧本：

library("RMySQL")
library(sqldf)
acs<-read.csv("getdata_data_ss06pid.csv",head = T)
sqldf("select pwgtp1 from acs where AGEP < 50")

Answer 1

在使用RMySQL时，您似乎不需要加载sqldf库，因为您已经将数据读入内存，这似乎是问题所在：

library(RMySQL)
library(sqldf)
sqldf("select * from df limit 6")

.local（drv，...）出错：无法连接到数据库：错误：无法通过socket＆＃39; /tmp/mysql.sock'连接到本地MySQL服务器; （2）错误！dbPreExists：无效的参数类型

但是，如果RMySQL库已分离，则sqldf有效：

detach("package:RMySQL", unload=TRUE)
sqldf("select * from df limit 6")
#   time  type
# 1    1 type1
# 2    2 type1
# 3    3 type2
# 4    4 type1
# 5    5 type2
# 6    6 type1

Answer 2

<强> TL; DR

在调用RMySql函数之前，显式将sqldf默认驱动程序选项设置为SQLite，而不是取消sqldf包的解码：

options(sqldf.driver = "SQLite")
sqldf("select * from df limit 6")

<强>解释

如果没有明确定义，sqldf包决定使用哪个DB驱动程序，如下所示：

如果未指定，则选中“dbDriver”选项，如果不是，则选中然后设置sqldf检查RPostgreSQL，RMySQL或RH2是否以该顺序加载并且驱动程序对应于第一个发现是用的。如果没有加载，则使用“SQLite”。 DBNAME = NULL 导致默认使用。

在您的情况下，RMySql已经加载，sqldf将尝试使用MySQL DB并写入名为test的模式。分离和卸载RMySQL包是一种选择，但不是必需的。正如@GaborGrothendieck在评论中所提到的，最简单的解决方法是简单告诉sqldf明确使用哪个DB驱动程序，即

sqldf("select * from df limit 6", drv="SQLite")

要始终不必添加drv="SQLite"，您可以将会话的默认驱动程序永久设置为SQLite：

options(sqldf.driver = "SQLite")

在r中使用sqldf时无法连接数据库

2 个答案: