R bnlearn无向弧

Question

我使用bnlearn：hc使用以下步骤构建了一个图形：

1. bootstrap使用hc算法500 bns
2. 计算最佳门槛
3. 提取具有阈值的最佳弧> “最佳阈值计算”和方向＆gt; 0.5

因此，如果我尝试使用1 bn进行自举，为了在小测试中更快，有时我会有一些无向弧。

在bnlearn中我怎么知道来自bn对象（学习结构）的无向弧是什么并将其删除？这将是最好的解决方案吗？

韩国社交协会

Answer 1

要查看哪些弧是无向的，您可以绘制网络。使用plot(network)或者，如果您拥有Rgraphviz包，则可以使用graphviz.plot(network)。

Answer 2

当有许多节点时，很难在图表中挑选出无向弧。在这种情况下，您可以使用undirected.arcs（）来查找它们。

用法如下：

boot = boot.strength(data = df, R=500, algorithm = 'hc', 
                     algorithm.args = list(score = 'bde'))
boot.avg = averaged.network(boot)
undirected.arcs(boot.avg)

您可以检查每个弧形方向的分数，以确保其不大于另一个：

score(set.arc(boot.avg, from="A", to="B", df)
score(set.arc(boot.avg, from="B", to="A", df)

最后你会想要设定这样的方向：

boot.avg = set.arc(boot.avg, from="A", to="B")

如果你想完全删除弧线，可以使用：

boot.avg = drop.arc(boot.avg, from="A", to="B")