R：尽管有NA值，但计算data.frame中cols的标准偏差

Question

早上好， 我得到了很多数据，我必须用它来计算。有25列（变量），每列包含数千个值。但也缺少价值观。 我用

计算了平均值

colMeans(df, na.rm = TRUE)

如何计算每列的sd并忽略NA值？

Answer 1

你可以尝试，

apply(df, 2, sd, na.rm = TRUE)

由于apply的输出是矩阵，并且您很可能必须转置它，因此更直接，更安全的选择是使用lapply或sapply，如@ docendodiscimus，

sapply(df, sd, na.rm = TRUE)

Answer 2

如果我们转换为matrix，则可以使用colSds中的matrixStats

library(matrixStats)
colSds(as.matrix(df), na.rm=TRUE) 

或者我们可以使用summarise_each

中的dplyr

library(dplyr)
df1 %>%
    summarise_each(funs(sd(., na.rm=TRUE)))

Answer 3

不推荐使用功能summarise_each()，下面是使用dplyr的最新示例：

df1 %>% summarise_all(funs(sd(., na.rm = FALSE)))

Answer 4

  

sd（variablenname，na.rm = TRUE）

这对我有用。将“ variablename”替换为您使用的变量。