R中的igraph和read.table，孤立顶点

Question

我看到R中的igraph要求数据结构如下：

Omnet++

我通过

看到了

nodeA  nodeB   int_1 int_2
AA      BD      6   X   
BD      CA      8   Y
AA      DE      7   Y
...     ...     ... ...

我获得了相应的网络。

现在说我必须放入隔离的节点，我在文档中搜索但找不到任何可以回答我问题的内容。

如何在原始文件中指定它们？

我想到了（比如.sif格式）

data<-read.table(file)
graph.data.frame(data)

但很明显，read.table不接受行之间不同数量的字段。

Answer 1

你可以这样试试：

data<-read.table(header=T, fill = TRUE, stringsAsFactors=F, text="
nodeA  nodeB   int_1 int_2
AA      BD      6   X   
BD      CA      8   Y
AA      DE      7   Y
ZZ
DE      BD      7   Y")
data[data==""] <- NA

library(igraph)
g <- graph.data.frame(
  data[complete.cases(data),], 
  vertices = unique(na.omit(unlist(data[1:2]))))
plot(g)