Question

我是MPI的新手，但我一直在尝试在具有OpenMPI的群集上使用它。我遇到以下问题：

$ python -c "from mpi4py import MPI"
Traceback (most recent call last):
  File "<string>", line 1, in <module>
ImportError: libmpi.so.1: cannot open shared object file: No such file or directory

我做了一些研究并尝试了一些方法，包括：

module load mpi/openmpi-x86_64

似乎没有任何改变。我的LD_LIBRARY_PATH似乎设置正确，但所需的“libmpi.so.1”不存在。相反，有“libmpi.so.12”：

$ echo $LD_LIBRARY_PATH 
/usr/lib64/openmpi/lib:/usr/local/matio/lib:/usr/lib64/mysql:/usr/local/knitro/lib:/usr/local/gurobi/linux64/lib:/usr/local/lib:
$ls /usr/lib64/openmpi/lib
... libmpi.so libmpi.so.12 libmpi.so.12.0.0 libmpi_usempi.so ...

我无法卸载/重新安装mpi4py，因为它在我的虚拟环境之外/我没有权限在普通群集上卸载它。我已经看到了这个：Error because file libmpi.so.1 missing，但不确定如何创建符号链接/不认为我有权修改文件夹。

我有点想法：不确定是否可以在我的virtualenv上单独安装mpi4py，或者我是否可以暂时为mpi4py指定正确的文件？

任何建议都将不胜感激！

更新：我按照建议运行find /usr -name libmpi.so.1 2>/dev/null，返回usr/lib64/compat-openmpi16/lib/libmpi.so.1。使用export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH"/usr/lib64/compat-openmpi16/lib/"，python -c "from mpi4py import MPI"运行没有任何问题。但是，如果我尝试mpiexec -np 2 python -c 'from mpi4py import MPI'，我会收到以下错误：

[[INVALID],INVALID] ORTE_ERROR_LOG: Not found in file ess_env_module.c at line 367
[[INVALID],INVALID]-[[28753,0],0] mca_oob_tcp_peer_try_connect: connect to 255.255.255.255:37376 failed: Network is unreachable (101)

Answer 1

即使添加到LD_LIBRARY_PATH对我也不起作用。我必须卸载mpi4py，然后根据此处的说明-https://mpi4py.readthedocs.io/en/stable/install.html（使用distutils部分）使用我的mpicc路径进行手动安装

mpi4py引用lipmpi.so.12作为lipmpi.so.1（说没有这样的文件或目录）

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