Question

我在不同的环境中使用numpy和scipy（MacOS，Ubuntu，RedHat）。通常我使用可用的包管理器安装numpy（例如，mac ports，apt，yum）。

但是，如果您不手动编译Numpy，您如何确定它使用BLAS库？使用mac端口，ATLAS作为依赖项安装。但是，我不确定它是否真的被使用过。当我执行简单的基准测试时，numpy.dot()函数需要大约。 2倍于使用Eigen C ++库计算的点积的时间。我不确定这是否是一个合理的结果..

祝你好运， APO

Answer 1

numpy.show_config()并不总能提供可靠的信息。例如，如果我在Ubuntu 14.04上apt-get install python-numpy，则np.show_config()的输出如下所示：

blas_info:
    libraries = ['blas']
    library_dirs = ['/usr/lib']
    language = f77
lapack_info:
    libraries = ['lapack']
    library_dirs = ['/usr/lib']
    language = f77
atlas_threads_info:
  NOT AVAILABLE
blas_opt_info:
    libraries = ['blas']
    library_dirs = ['/usr/lib']
    language = f77
    define_macros = [('NO_ATLAS_INFO', 1)]
atlas_blas_threads_info:
  NOT AVAILABLE
openblas_info:
  NOT AVAILABLE
lapack_opt_info:
    libraries = ['lapack', 'blas']
    library_dirs = ['/usr/lib']
    language = f77
    define_macros = [('NO_ATLAS_INFO', 1)]
...

看起来numpy正在使用标准的CBLAS库。但是，我知道numpy正在使用OpenBLAS，我是通过libopenblas-dev包安装的。

检查* nix的最明确方法是使用ldd找出运行时哪些共享库numpy链接（我不拥有Mac，但我认为你可以使用{{ 1}}代替otool -L）。

对于早于v1.10的numpy版本：
```
ldd
```
如果~$ ldd /<path_to_site-packages>/numpy/core/_dotblas.so不存在，这可能意味着numpy在最初编译时未能检测到任何BLAS库，在这种情况下它根本不构建任何BLAS依赖库组件。
适用于numpy v1.10及更新版本：

_dotblas.so has been removed，但您可以检查_dotblas.so的依赖关系：
```
multiarray.so
```

查看我通过~$ ldd /<path_to_site-packages>/numpy/core/multiarray.so安装的numpy版本：

apt-get

~$ ldd /usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/core/_dotblas.so linux-vdso.so.1 => (0x00007fff12db8000) libblas.so.3 => /usr/lib/libblas.so.3 (0x00007fce7b028000) libc.so.6 => /lib/x86_64-linux-gnu/libc.so.6 (0x00007fce7ac60000) libm.so.6 => /lib/x86_64-linux-gnu/libm.so.6 (0x00007fce7a958000) libpthread.so.0 => /lib/x86_64-linux-gnu/libpthread.so.0 (0x00007fce7a738000) /lib64/ld-linux-x86-64.so.2 (0x00007fce7ca40000)实际上是一系列符号链接的开始。如果我使用/usr/lib/libblas.so.3将它们跟踪到最终目标，我会看到它们指向我的OpenBLAS共享库：

readlink -e

Answer 2

numpy.show_config（）只是告诉我的Debian Linux上没有这些信息。

然而/ usr / lib / python3 / dist-packages / scipy / lib有一个blas的子目录，它可以告诉你你想要什么。在子目录测试中有几个BLAS测试程序。

希望这有帮助。

Answer 3

您想检查numpy.show_config()以查看已配置的库。

找出Numpy是否使用了哪个BLAS库

3 个答案: