如何将文件和目录从Windows复制到Linux

Question

我想从NTFS Windows文件系统复制文件，创建相同的目录并将所有文件移动到EXT3文件系统。有没有办法安全正确地使用CLI？我可以挂载Nautilus可用的NTFS文件系统。使用Fedora 21 OS。