Question

我在通过Rscript运行时执行依赖于方法包的函数时遇到了一些麻烦。我已经知道方法不是通过Rscript 附加，但它应该由依赖包加载（并且可用）并且可以通过它们的包名称空间访问，至少我是这么认为的...

示例R脚本（通过Rscript执行）：

#!/usr/bin/Rscript

sessionInfo()

tryCatch({
    str(lubridate::days(30))
}, error = function(e) {
    print(e)
})

sessionInfo()

tryCatch({
    str(lubridate::days(30))
}, error = function(e) {
    print(e)
})

library(methods)
str(lubridate::days(30))
sessionInfo()

输出，我的评论和问题在下面混合......

首先，这是启动sessionInfo()：

# sessionInfo()

R version 3.2.2 (2015-08-14)
Platform: x86_64-redhat-linux-gnu (64-bit)
Running under: Amazon Linux AMI 2015.09

locale:
 [1] LC_CTYPE=en_US.UTF-8       LC_NUMERIC=C
 [3] LC_TIME=en_US.UTF-8        LC_COLLATE=en_US.UTF-8
 [5] LC_MONETARY=en_US.UTF-8    LC_MESSAGES=en_US.UTF-8
 [7] LC_PAPER=en_US.UTF-8       LC_NAME=C
 [9] LC_ADDRESS=C               LC_TELEPHONE=C
[11] LC_MEASUREMENT=en_US.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C

attached base packages:
[1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  base

正如预期的Rscript一样，包方法未附加，也未加载。

现在，让我感到惊讶的是，我认为lubridate::days(30)调用会加载方法，因为 lubridate 包有＆＃34 ;依靠＆＃34; 方法，在 lubridate 的DESCRIPTION文件中验证。相反，我得到错误：

# tryCatch({
#     str(lubridate::days(30))
# }, error = function(e) {
#     print(e)
# })

<simpleError in .setupMethodsTables(fdef, initialize = TRUE): trying to get slot "group" from an object of a basic class ("NULL") with no slots>

但现在我真的感到困惑，因为方法似乎已经加载了，正如下一个{{ 1}}来电：

sessionInfo()

为了确保（关于我的困惑），让我们再次尝试拨打# sessionInfo() R version 3.2.2 (2015-08-14) Platform: x86_64-redhat-linux-gnu (64-bit) Running under: Amazon Linux AMI 2015.09 locale: [1] LC_CTYPE=en_US.UTF-8 LC_NUMERIC=C [3] LC_TIME=en_US.UTF-8 LC_COLLATE=en_US.UTF-8 [5] LC_MONETARY=en_US.UTF-8 LC_MESSAGES=en_US.UTF-8 [7] LC_PAPER=en_US.UTF-8 LC_NAME=C [9] LC_ADDRESS=C LC_TELEPHONE=C [11] LC_MEASUREMENT=en_US.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C attached base packages: [1] stats graphics grDevices utils datasets base loaded via a namespace (and not attached): [1] magrittr_1.5 tools_3.2.2 lubridate_1.5.6.9000 [4] stringi_1.0-1 methods_3.2.2 stringr_1.0.0：

lubridate::days(30)

同样的错误。

好的，现在让我们明确附加方法并再次尝试# tryCatch({ # str(lubridate::days(30)) # }, error = function(e) { # print(e) # }) <simpleError in .setupMethodsTables(fdef, initialize = TRUE): trying to get slot "group" from an object of a basic class ("NULL") with no slots>来电：

lubridate::days(30)

那很有效！具体通过附加方法改变了什么？：

# library(methods)
# str(lubridate::days(30))

Formal class 'Period' [package "lubridate"] with 6 slots
  ..@ .Data : num 0
  ..@ year  : num 0
  ..@ month : num 0
  ..@ day   : num 30
  ..@ hour  : num 0
  ..@ minute: num 0

方法现已附加（与已加载但未附加相对）。

我知道我可以通过简单地在脚本上包含# sessionInfo() R version 3.2.2 (2015-08-14) Platform: x86_64-redhat-linux-gnu (64-bit) Running under: Amazon Linux AMI 2015.09 locale: [1] LC_CTYPE=en_US.UTF-8 LC_NUMERIC=C [3] LC_TIME=en_US.UTF-8 LC_COLLATE=en_US.UTF-8 [5] LC_MONETARY=en_US.UTF-8 LC_MESSAGES=en_US.UTF-8 [7] LC_PAPER=en_US.UTF-8 LC_NAME=C [9] LC_ADDRESS=C LC_TELEPHONE=C [11] LC_MEASUREMENT=en_US.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C attached base packages: [1] methods stats graphics grDevices utils datasets base loaded via a namespace (and not attached): [1] magrittr_1.5 tools_3.2.2 lubridate_1.5.6.9000 [4] stringi_1.0-1 stringr_1.0.0来解决所有令人头疼的问题，但这看起来很愚蠢，因为我认为加载方法会对底层包具有相同的影响（到期）到R的包命名空间），我不必具体了解我使用的任何包依赖于方法。

这看起来像是一个R问题，或者可能是我的（可能是不幸的选择）示例包 lubridate 的命名空间问题？

使用package :: object notation

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