我有一个numpy数组,其中包含以下格式的数字数据:
example = numpy.array([[[i for i in range(0, 5)],[0 for j in range(0, 5)]] for k in range(0, 10)])
所以它是10个组的数组,其中每个组由2个相等长度的列表组成,只包含数字。 运行以下保存代码会给出以下错误:
numpy.savetxt('exampleData.csv', test, delimiter=',')
TypeError: Mismatch between array dtype ('int32') and format specifier ('%.18e %.18e')
我猜这可以通过fmt =' xyz'中的内容来解决。论证,但文件并不是特别清楚。任何帮助将不胜感激。
(在我的实际数据中,i和j列表是长浮点数列表,例如' 0.0047322940571'等。)
答案 0 :(得分:9)
您的example
是一个3d数组
In [82]: example=np.array([[[i for i in range(0, 5)],[0 for j in range(0, 5)]] for k in range(0, 3)]) # chg 10 to 3 for display
In [83]: example.shape
Out[83]: (3L, 2L, 5L)
In [84]: example
Out[84]:
array([[[0, 1, 2, 3, 4],
[0, 0, 0, 0, 0]],
[[0, 1, 2, 3, 4],
[0, 0, 0, 0, 0]],
[[0, 1, 2, 3, 4],
[0, 0, 0, 0, 0]]])
尝试保存整个内容会导致错误(由于版本不同而导致不同的消息):
In [87]: np.savetxt('test.csv',example, delimiter=',')
....
TypeError: float argument required, not numpy.ndarray
但保存一个'行'是可以的
In [88]: np.savetxt('test.csv',example[1,...], delimiter=',')
使用整数格式保存可以产生更漂亮的输出
In [94]: np.savetxt('test.csv',example[1,...], delimiter=',',fmt='%d')
In [95]: with open('test.csv') as f:print f.read()
0,1,2,3,4
0,0,0,0,0
那么你想如何保存3d数组呢?请记住您将如何使用/阅读它。多个文件?一个文件中有多个块?
https://stackoverflow.com/a/3685339/901925
关于如何保存3d数组是一个6岁的答案。简单的答案是打开一个文件,并为数组的切片执行多个savetxt
。这将数据保存在块中。但加载这些块是另一个问题(之前出现过)。
In [100]: with open('test.csv','w') as f:
...: for row in example:
...: np.savetxt(f,row,delimiter=',',fmt='%d',footer='====')
...:
In [101]: with open('test.csv') as f:print f.read()
0,1,2,3,4
0,0,0,0,0
# ====
0,1,2,3,4
0,0,0,0,0
# ====
0,1,2,3,4
0,0,0,0,0
# ====
在回复您的评论时,这是有效的
example=np.ones((4,2,100))
np.savetxt('test.csv',example[1,...], delimiter=',',fmt='%.18e')
保存3d数组的另一种方法是将其重塑为2d。您在加载后将其重新整形为3d,可能使用存储在注释行中的信息
np.savetxt('test.csv',example.reshape(-1,example.shape[-1]), delimiter=',',fmt='%.18e')
答案 1 :(得分:0)
import numpy
example = numpy.array([[[i for i in range(0, 5)],[0 for j in range(0, 5)]] for k in range(0, 10)])
f = open('exampleData.csv', 'ab')
for i in example:
numpy.savetxt(f, i, fmt='%i')