我正在使用以下代码
从sklearn库中保存RandomForestClassifier模型with open('/tmp/rf.model', 'wb') as f:
cPickle.dump(RF_model, f)
我的硬盘需要很大的空间。模型中只有50棵树,但它在磁盘上占用超过50 MB(分析的数据集大约为20MB,具有21个功能)。有人知道为什么吗?我观察到ExtraTreesClassifier的类似行为。
编辑: 射频参数:
"n_estimators": 50,
"max_features": 0.2,
"min_samples_split": 20,
"criterion": "gini",
"min_samples_leaf": 11
正如@dooms所建议我检查了sys.getsizeof并返回64 - 我认为这只是指针大小。
我尝试了其他方式来保存模型:
from sklearn.externals import joblib
joblib.dump(RF_model, 'filename.pkl')
通过使用这种方式,我得到1 * .pkl文件和201 * .npy文件,总大小为14.9 MB,因此小于之前的53 MB。这些201 npy文件中有一个模式 - Forest中每个树有4个文件:
第一个文件(231 KB)内容:
array([(1, 1062, 20, 0.2557438611984253, 0.4997574055554296, 29168, 46216.0),
(2, 581, 12, 0.5557271242141724, 0.49938159451291675, 7506, 11971.0),
(3, 6, 14, 0.006186043843626976, 0.4953095968671224, 4060, 6422.0),
...,
(4123, 4124, 15, 0.6142271757125854, 0.4152249134948097, 31, 51.0),
(-1, -1, -2, -2.0, 0.495, 11, 20.0),
(-1, -1, -2, -2.0, 0.3121748178980229, 20, 31.0)],
dtype=[('left_child', '<i8'), ('right_child', '<i8'), ('feature', '<i8'), ('threshold', '<f8'), ('impurity', '<f8'), ('n_node_samples', '<i8'), ('weighted_n_node_samples', '<f8')])
第二个文件(66 kB)内容:
array([[[ 2.25990000e+04, 2.36170000e+04]],
[[ 6.19600000e+03, 5.77500000e+03]],
[[ 3.52200000e+03, 2.90000000e+03]],
...,
[[ 3.60000000e+01, 1.50000000e+01]],
[[ 1.10000000e+01, 9.00000000e+00]],
[[ 2.50000000e+01, 6.00000000e+00]]])
第三个文件(88B):
array([2])
组(96B)中的最后一个文件:
array([ 0., 1.])
任何想法是什么?我试着在sklearn中查看Tree代码,但这很难。任何想法如何保存sklearn树,它存储更少的磁盘? (只是指出xgboost类似大小的整体占用了大约200KB)
答案 0 :(得分:-1)
我已经看到使用pickle转储的相同行为。转储大约是size in memory的10倍。
from sys import getsizeof
memory_size = getsizeof(RF_model)
查看是否存在巨大差异,如果是这种情况,请参阅another way以保存您的模型。