无法在带序模式下写入像素块

时间:2016-04-04 20:27:55

标签: c gis gsl envi

我正在使用带有bsq类型(带序列)的交错的ENVI图像文件(.hdr labbeled)。我正在尝试对大约350MB的图像进行主成分转换。为了做到这一点,我不得不在较小的内存块中单独处理它。如果文件只能在一个内存块中使用,则下面的代码按预期工作。但是,如果它需要多次迭代,则只有最后一个块按预期出现,即,所有先前的块都被写入,好像它们是一遍又一遍地重复相同的像素。

extern void pca_xform(envi_header file){

    #define BLOCK_SIZE 3000000

          /*Calculates covariance_matrix, eigen_matrix, mean_vector 
    and allocates pixel_vector and xform_pixel_vector*/

      int size = (file.lines)*(file.samples), i;

      printf("Transforming\n");

      int n = size/BLOCK_SIZE;
      int r = size - ((BLOCK_SIZE)*n);
      int block;

      for(i=0,block=0;i<n+1;++i,++block){
        int actual_size = BLOCK_SIZE;
        if(i==n){
          actual_size = r;
        }
        int k;
        io_bsq_read_pixel(file, i*BLOCK_SIZE, actual_size, pixel_vector);
        for(k=0;k<actual_size;++k){
          pca_normalize_pixel_vector(mean_vector, pixel_vector[k]);
        }
        for(k=0;k<actual_size;++k){
          pca_xform_pixel_vector(file, eigen_matrix, pixel_vector[k], xform_pixel_vector[k]);
        }
        io_bsq_write_pixel(file, i*BLOCK_SIZE, actual_size, xform_pixel_vector);
      }

      return;
    }

这是写作功能。

extern void io_bsq_write_pixel(envi_header file, int start, int number, gsl_vector** pixel_vector){
  FILE* fp = fopen(file.new_filename, "wb");
  if(!fp){
    fprintf(stderr, "Failed to open target: %s\n", file.new_filename);
    exit(EXIT_FAILURE);
  }
  int size = (file.samples) * (file.lines);
  int i, j;
  double d;
  for(i=0;i<file.bands;++i){
    fseek(fp, sizeof(double)*((size*i)+start), SEEK_SET);
    for(j=0;j<number;++j){
      d = gsl_vector_get(pixel_vector[j], i);
      fwrite(&d, sizeof(double), 1, fp);
    }
  }
  fclose(fp);
  return;
}

我得出结论,意外的行为是由于这个函数本身或者在pca_xform函数中对它的一些不恰当的调用。为此,我只使用下面的代码,它按顺序写入像素(双向交错)。

for(i=0;i<size:++i){
   gsl_vector_fwrite(fp, xform_pixel_vector[i]);
 }

但是,我希望将输出文件保持为带序列。我花了很多时间试图找到解决方案,在这里和那里调整代码,但问题的解决方案仍然无法解决。

1 个答案:

答案 0 :(得分:0)

我终于找到了问题的根源。问题是我现在倾向于相信文件中写作程序的位置。然而,它仍然在io_bsq_write_pixel。每次我调用该函数时,它都会随后调用fwrite(file.new_filename, "w")。在&#34; w&#34; 模式下打开文件会删除我以前的所有工作。为了解决这个问题,我在调用pca_xform之前初始化了文件,然后更改了io_bsq_write_pixel

    extern void io_bsq_write_pixel(envi_header file, int start, int number, gsl_vector** pixel_vector){
  FILE* fp = fopen(file.new_filename, "r+b");
  if(!fp){
    fprintf(stderr, "Failed to open target: %s\n", file.new_filename);
    exit(EXIT_FAILURE);
  }
  int size = (file.samples) * (file.lines);
  int i, j;
  double d;
  for(i=0;i<file.bands;++i){
    fseek(fp, sizeof(double)*((size*i)+start), SEEK_SET);
    for(j=0;j<number;++j){
      d = gsl_vector_get(pixel_vector[j], i);
      fwrite(&d, sizeof(double), 1, fp);
    }
  }
  fclose(fp);
  return;
}

这样,使用&#34; r + b&#34; 并首先初始化文件,我保证它会打开文件进行简单更新,而不会删除我之前的工作。