细胞分割

Question

我是计算机视觉的新手。我的目标是区分一组图片上的单个单元格：Example

基本上，我模糊整个图像，在其上找到最大区域，并像分水岭算法中的种子一样使用它来对三角形模糊图像的距离转换形成。事实上我正在按照你在这里找到的教程：

  

的github / luispedro /蟒图像教程

（抱歉，不能发布2个以上的链接）。

我的问题是我的集合中的某些单元格具有非常明显的暗核（您可以在示例中看到），而我的算法会产生类似this的结果，这些结果很明显。

当然可以通过增加高斯模糊的强度来修复它，但它会将其他一些细胞合并到更糟糕的情况。

可以采取哪些措施来解决这个问题？如果分水岭在这种情况下不适合，还有什么其他的可能性（请记住，我的设置非常小，学习似乎不可能）？

Answer 1

如果你不使用带有标记的分水岭，分水岭往往会过度分割。

通常，我们从简单的DNA / DAPI分割开始，它提供了分水岭的细胞数量和内部标记。

如果模糊图像，则会平滑所有图案。您应该使用备用顺序过滤器（打开/关闭）以简化每个区域，然后尝试最终侵蚀，以便找到您的分水岭的内部种子数。