假设我有以下数据集1
我想在同一图表上为每个水记录器值制作箱线图。我检查过的每个地方都有一个要使用的因子变量。但是,我不想要因素,我将水记录器编号作为列名。我可以使用通用的boxplot命令执行此操作:boxplot(data$colname1, data$colname2, data$colname3, and so on)
但是如何使用更好的图形来完成此操作,例如在ggplot2
中。
答案 0 :(得分:2)
如果没有实际数据,很难向您展示您需要使用的确切代码,但在对png
进行一瞥之后,我建议您尝试以下几行:
library(reshape2)
library(ggplot2)
df <- melt(your_data)
ggplot(df, aes(x=variable, y=value)) + geom_boxplot()
此代码可能需要一些调整。如果它不起作用且调整不明显,请以便于我们使用它的方式发布一些示例数据。屏幕截图中的数据意味着我们必须手动复制粘贴每个数字,而很少有人愿意这样做。
澄清一般过程:melt
将所有列“叠加”在一起,并添加一个名为variable
的变量,该变量引用旧列名称。您可以将其移至ggplot
并说明variable
的不同值应位于x
轴上,这就是您想要的。例如,看看women
:
head(women)
height weight
1 58 115
2 59 117
3 60 120
4 61 123
5 62 126
6 63 129
str(women)
'data.frame': 15 obs. of 2 variables:
$ height: num 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 ...
$ weight: num 115 117 120 123 126 129 132 135 139 142 ...
您看到women
是一个包含15个观察值和两列height
和weight
的数据框。
现在,让我们melt
他们:
df <- melt(women)
head(df)
variable value
1 height 58
2 height 59
3 height 60
4 height 61
5 height 62
6 height 63
str(df)
'data.frame': 30 obs. of 2 variables:
$ variable: Factor w/ 2 levels "height","weight": 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 ...
$ value : num 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 ...
现在您看到它有30个观察点和两列:variable
和value
。 variable
标识旧列。
让我们把它交给ggplot
:
ggplot(df, aes(x=variable, y=value)) + geom_boxplot()
的产率:
这里有原始women
数据集中两列的箱图。
答案 1 :(得分:0)
这是基于与coffeinjunky相同原理的另一个答案,但更具体到您的数据集。由于您没有提供数据集,因此我创建了一个具有相似列名的虚拟数据集:
d <- data.frame(x=rep(0,8))
d$`Logger 1_Water_Level` <- c(1,2,3,4,5,3,4,5)
d$`Logger 2_Water_Level` <- c(7,9,2,6,8,9,2,3)
您需要重新整形数据集,以便获得标识记录器的因子变量。假设您有两个记录器并且记录器中的数据存储在第2列和第3列中,您可以使用以下代码从存储数据的宽格式(即每个记录器的单独列)到长使用ggplot2
进行绘图所需的格式(即用于水位测量的单列,每个记录器由名为Logger
的列中的数字标识)
d_long <- reshape(d, varying=2:3, direction="long", timevar="Logger",v.names="Water_Level", times=1:2)
d_long$Logger <- as.factor(d_long$Logger)
现在您可以使用ggplot2
绘制测量值:
p <- ggplot(d_long, aes(x=Logger, y=Water_Level))
p <- p + geom_boxplot()
p