我正在尝试使用Spark SQL来编写parquet
文件。
默认情况下,Spark SQL支持gzip
,但它也支持其他压缩格式,如snappy
和lzo
。
这些压缩格式之间有什么区别,哪种格式最适合Hive
加载。
答案 0 :(得分:15)
只需尝试使用您的数据。
lzo和snappy是快速压缩器和非常快速的解压缩程序,但压缩程度较低,与gzip相比压缩效果更好,但速度稍慢。
答案 1 :(得分:14)
如果您可以处理更高的磁盘使用率以获得性能优势(使用较低的CPU + Splittable),请使用Snappy。
当Spark默认从GZIP切换到Snappy时,这就是原因:
根据我们的测试,gzip解压缩非常慢(<100MB / s), 使查询解压缩绑定。 Snappy可以以~500MB / s的速度解压缩 在一个核心上。
的Snappy:
GZIP:
1)http://boristyukin.com/is-snappy-compressed-parquet-file-splittable/
答案 2 :(得分:2)
根据下面的数据,我想说gzip
在流式传输之外的情况下胜出,在这种情况下,写入时间延迟很重要。
请记住,速度本质上是计算成本,这一点很重要。但是,云计算是一次性成本,而云存储是经常性成本。权衡取决于数据的保留期限。
让我们用Python中大小为parquet
的文件测试速度和大小。
结果(大文件,117 MB):
+----------+----------+--------------------------+
| snappy | gzip | (gzip-snappy)/snappy*100 |
+-------+----------+----------+--------------------------+
| write | 1.62 ms | 7.65 ms | 372% slower |
+-------+----------+----------+--------------------------+
| size | 35484122 | 17269656 | 51% smaller |
+-------+----------+----------+--------------------------+
| read | 973 ms | 1140 ms | 17% slower |
+-------+----------+----------+--------------------------+
结果(小文件,4 KB,虹膜数据集):
+---------+---------+--------------------------+
| snappy | gzip | (gzip-snappy)/snappy*100 |
+-------+---------+---------+--------------------------+
| write | 1.56 ms | 2.09 ms | 33.9% slower |
+-------+---------+---------+--------------------------+
| size | 6990 | 6647 | 5.2% smaller |
+-------+---------+---------+--------------------------+
| read | 3.22 ms | 3.44 ms | 6.8% slower |
+-------+---------+---------+--------------------------+
small_file.ipynb
import os, sys
import pyarrow
import pandas as pd
import numpy as np
from sklearn.datasets import load_iris
iris = load_iris()
df = pd.DataFrame(
data= np.c_[iris['data'], iris['target']],
columns= iris['feature_names'] + ['target']
)
# ========= WRITE =========
%timeit df.to_parquet(path='iris.parquet.snappy', compression='snappy', engine='pyarrow', index=True)
# 1.56 ms
%timeit df.to_parquet(path='iris.parquet.gzip', compression='snappy', engine='pyarrow', index=True)
# 2.09 ms
# ========= SIZE =========
os.stat('iris.parquet.snappy').st_size
# 6990
os.stat('iris.parquet.gzip').st_size
# 6647
# ========= READ =========
%timeit pd.read_parquet(path='iris.parquet.snappy', engine='pyarrow')
# 3.22 ms
%timeit pd.read_parquet(path='iris.parquet.gzip', engine='pyarrow')
# 3.44 ms
large_file.ipynb
import os, sys
import pyarrow
import pandas as pd
df = pd.read_csv('file.csv')
# ========= WRITE =========
%timeit df.to_parquet(path='file.parquet.snappy', compression='snappy', engine='pyarrow', index=True)
# 1.62 s
%timeit df.to_parquet(path='file.parquet.gzip', compression='gzip', engine='pyarrow', index=True)
# 7.65 s
# ========= SIZE =========
os.stat('file.parquet.snappy').st_size
# 35484122
os.stat('file.parquet.gzip').st_size
# 17269656
# ========= READ =========
%timeit pd.read_parquet(path='file.parquet.snappy', engine='pyarrow')
# 973 ms
%timeit pd.read_parquet(path='file.parquet.gzip', engine='pyarrow')
# 1.14 s
答案 3 :(得分:0)
我同意1个答案(@Mark Adler)并有一些研究信息[1],但我不同意第二个答案(@Garren S)[2]。也许Garren误解了这个问题,因为: [2]可使用所有受支持的编解码器拆分的Parquet:Is gzipped Parquet file splittable in HDFS for Spark?,Tom White的Hadoop:权威指南,第4版,第5章:Hadoop I / O,第106页。 [1]我的研究: 源数据-205 GB。文本(分隔的字段),未压缩。 输出数据:
<!DOCTYPE html>
<html>
<head>
<style>
table,
th,
td {
border: 1px solid black;
border-collapse: collapse;
}
</style>
</head>
<body>
<table style="width:100%">
<tr>
<th></th>
<th>time of computing, hours</th>
<th>volume, GB</th>
</tr>
<tr>
<td>ORC with default codec</td>
<td>3-3,5</td>
<td>12.3</td>
</tr>
<tr>
<td>Parquet with GZIP</td>
<td>3,5-3,7</td>
<td>12.9</td>
</tr>
<tr>
<td>Parquet with SNAPPY</td>
<td>2,5-3,0</td>
<td>60.4</td>
</tr>
</table>
</body>
</html>
使用Hive在2 m4.16xlarge的EMR上进行转化。 转换-按几个字段的顺序选择所有字段。 当然,这项研究不是标准的,但至少有一点表明了真正的比较。对于其他数据集,计算结果可能有所不同。
答案 4 :(得分:0)
压缩率: GZIP压缩比Snappy或LZO占用更多的CPU资源,但提供更高的压缩率。
常规用法: 对于不经常访问的冷数据,GZip通常是一个不错的选择。 对于经常访问的 hot 数据,Snappy或LZO是更好的选择。
Snappy的性能通常优于LZO。值得运行测试以查看是否检测到显着差异。
可拆分性: 如果需要压缩数据是可拆分的,则BZip2,LZO和Snappy格式是可拆分的,而GZip则不可。
与消耗Snappy数据的GZIP相比,读取GZIP数据时的GZIP压缩数据比Snappy多30%,CPU多2倍。
LZO专注于在低CPU使用率和更高压缩率下以更高的CPU成本为代价的解压缩速度。
对于 长期/静态 存储,GZip压缩仍然更好。