在R中，当比较2个数据帧

Question

我有2个数据框（A和B，每个包含5列），由2个.csv文件创建。我想比较A中的2列（A1_maj和A2_min）和B中的2列，它们包含A，T，C，G类的值。这是一个例子：

A:                         B:

A1_maj  A2_min              A1_maj  A2_min
C       T                   C       T                   
C       T                   C       T 
G       A                   G       A
G       A                   A       G
T       C                   G       A

我有一个很长的代码，但我遇到了一个命令。每当我尝试使用以下逻辑语句比较A和B中的列时，我会收到一条错误消息：

逻辑陈述：

A$A1_maj == B$A2_min
A$A1_maj != B$A2_min

错误讯息：

Error in Ops.factor(A$A1_maj, B$A2_min) :
level sets of factors are different

另一方面，当我包含这样的逻辑语句（见下文）时，我得到一个正确的输出（TRUE或FALSE值）：

A$A1_maj != B$A1_maj

我在之前的帖子中读到，当我创建数据框时，我应该包含“stringsAsFactors = FALSE”，因为我可能已经将字符向量转换为因子，但这没有任何区别

欢迎任何建议！

Answer 1

@Roland建议的解决方案是将A和B中的所有因子转换为字符：

i <- sapply(A, is.factor)
A[i] <- lapply(A[i], as.character)

i <- sapply(B, is.factor)
B[i] <- lapply(B[i], as.character)