Question

我想对其字母进行分割。举个例子如下：

给出的二进制文件采用csv格式：

A=1000, C=0100, G=0010, T=0001

binary.csv：CAT，GAA

0,1,0,0,1,0,0,0,0,0,0,1
0,0,1,0,1,0,0,0,1,0,0,0

binary.csv需要与csv文件中的单行值相乘。

single.csv：

0.28,0.22,0.23,0.27,0.12,0.29,0.34,0.21,0.44,0.56,0.51,0.65

下面的代码对文件和输出中的值进行乘法运算：

0.22,0.12,0.65
0.23,0.12,0.44

代码

import csv

with open('single.csv', 'rb') as csvfile:
    for row in csv.reader(csvfile, delimiter=','):
        reals = row

with open('binary.csv', 'rb') as csvfile:
    pwreader = csv.reader(csvfile, delimiter=',')

    with open('output.csv','wb') as testfile:
        csv_writer=csv.writer(testfile)
        for row in pwreader:
            result = []            
            for i,b in enumerate(row):
                if b == '1' :
                    result.append(reals[i])
            csv_writer.writerow(result)

我有额外的csv文件，我想先前执行除法输出和相对于其字母表划分的值：

 A   C   G   T
 0.4,0.5,0.7,0.1
 0.2,0.8,0.9,0.3

CAT的值除以0.5,0.4,0.1，GAA除以0.9,0.2,0.2，这样我就可以得到一个全新的输出如下：

 0.44,0.3,6.5
 0.26,0.6,2.2

在数组上使用numpy可能会解决这个问题，但是当使用超过几千个数据时，它可能不合适。当我尝试使用60,000 ++数据时发生内存不足。

任何人都可以帮助我吗？

Python：如何根据指定的特定值划分csv文件中的行值？

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