Question

我很难将R markdown文档编译并执行。我在分析中有单向，双向ANOVA和ANCOVA分析以及许多图。

这是第一个尚未成功执行的R代码块。

{r, echo=FALSE}

install.packages("rmarkdown")
library(rmarkdown)

install.packages("knitr")
library(knitr)

install.packages("ggplot2")

install.packages("car")
library(car)

install.packages("pastecs")
library(pastecs)

install.packages("compute.es")
library(compute.es)

install.packes("multcomp")
library(multcopm)

install.packes("WRS2")
library(WRS2)

install.packages("gmodels")
library(gmodels)

install.packes("MASS")
library(MASS)

退出第30-60行（PPC.Rmd）contrib.url错误（repos，   ＆＃34; source＆＃34;）：尝试在不设置镜像的情况下使用CRAN调用：    ... withVisible - ＆gt; eval - ＆gt; eval - ＆gt; install.packages - ＆gt;   contrib.url

执行暂停

Answer 1

我通常带小功能

check_and_install <- function( packname ) { # given package name, check installation, install if not found
    if ( packname %in% rownames(installed.packages()) == FALSE ) {
        install.packages( packname )
    }
}

所以在Rmd的开始我做

check_and_install("ggplot2")
library(ggplot2)

....

无法编译Rmarkdown文档

1 个答案: