我是 C ++ / CUDA 的新手。我尝试实现并行算法" reduce "能够处理任何类型的inputize和threadsize,而不会通过递归内核的输出(在内核包装器中)来增加渐近并行运行时。
e.g。 Implementing Max Reduce in Cuda这个问题的最佳答案,当线程化足够小时,他/她的实现基本上是顺序的。
但是,我不断收到" 细分错误"当我编译并运行它..?
>> nvcc -o mycode mycode.cu
>> ./mycode
Segmentail fault.
使用cuda 6.5在K40上编译
这是内核,与SO帖子基本相同,我将检查器链接到"越界"与众不同:
#include <stdio.h>
/* -------- KERNEL -------- */
__global__ void reduce_kernel(float * d_out, float * d_in, const int size)
{
// position and threadId
int pos = blockIdx.x * blockDim.x + threadIdx.x;
int tid = threadIdx.x;
// do reduction in global memory
for (unsigned int s = blockDim.x / 2; s>0; s>>=1)
{
if (tid < s)
{
if (pos+s < size) // Handling out of bounds
{
d_in[pos] = d_in[pos] + d_in[pos+s];
}
}
}
// only thread 0 writes result, as thread
if (tid==0)
{
d_out[blockIdx.x] = d_in[pos];
}
}
内核包装器我提到要处理1个块不包含所有数据的时间。
/* -------- KERNEL WRAPPER -------- */
void reduce(float * d_out, float * d_in, const int size, int num_threads)
{
// setting up blocks and intermediate result holder
int num_blocks = ((size) / num_threads) + 1;
float * d_intermediate;
cudaMalloc(&d_intermediate, sizeof(float)*num_blocks);
// recursively solving, will run approximately log base num_threads times.
do
{
reduce_kernel<<<num_blocks, num_threads>>>(d_intermediate, d_in, size);
// updating input to intermediate
cudaMemcpy(d_in, d_intermediate, sizeof(float)*num_blocks, cudaMemcpyDeviceToDevice);
// Updating num_blocks to reflect how many blocks we now want to compute on
num_blocks = num_blocks / num_threads + 1;
// updating intermediate
cudaMalloc(&d_intermediate, sizeof(float)*num_blocks);
}
while(num_blocks > num_threads); // if it is too small, compute rest.
// computing rest
reduce_kernel<<<1, num_blocks>>>(d_out, d_in, size);
}
初始化输入/输出并创建虚假数据以进行测试的主程序。
/* -------- MAIN -------- */
int main(int argc, char **argv)
{
// Setting num_threads
int num_threads = 512;
// Making bogus data and setting it on the GPU
const int size = 1024;
const int size_out = 1;
float * d_in;
float * d_out;
cudaMalloc(&d_in, sizeof(float)*size);
cudaMalloc((void**)&d_out, sizeof(float)*size_out);
const int value = 5;
cudaMemset(d_in, value, sizeof(float)*size);
// Running kernel wrapper
reduce(d_out, d_in, size, num_threads);
printf("sum is element is: %.f", d_out[0]);
}
答案 0 :(得分:4)
我会用你的代码指出一些事情。
作为一般规则/样板文件,我始终建议您使用proper cuda error checking,并在遇到cuda代码时遇到问题时使用cuda-memcheck
运行代码。然而,这些方法对seg故障没有多大帮助,尽管它们可能会有所帮助(见下文)。
实际的seg故障发生在这一行:
printf("sum is element is: %.f", d_out[0]);
你破坏了一个基本的CUDA编程规则:不能在设备代码中取消引用主机指针,并且不得在主机代码中取消引用设备指针。后一种情况适用于此。 d_out
是设备指针(通过cudaMalloc
分配)。如果您尝试在主机代码中取消引用它们,则此类指针无意义,这样做会导致seg错误。
解决方案是在打印出来之前将数据复制回主机:
float result;
cudaMemcpy(&result, d_out, sizeof(float), cudaMemcpyDeviceToHost);
printf("sum is element is: %.f", result);
在循环中使用cudaMalloc
,在同一个变量上,不进行任何cudaFree
操作,这不是一个好习惯,并且可能导致长时间运行时出现内存不足错误循环,并且如果在更大的程序中使用这样的构造,也可能导致具有内存泄漏的程序:
do
{
...
cudaMalloc(&d_intermediate, sizeof(float)*num_blocks);
}
while...
在这种情况下,我认为在您重新分配之前,更好的方法和简单的解决方法是cudaFree
d_intermediate
:
do
{
...
cudaFree(d_intermediate);
cudaMalloc(&d_intermediate, sizeof(float)*num_blocks);
}
while...
这可能不是你想象的那样:
const int value = 5;
cudaMemset(d_in, value, sizeof(float)*size);
可能您已经意识到这一点,但cudaMemset
与memset
一样,对字节数量进行操作。因此,您使用与d_in
对应的值填充0x05050505
数组(当解释为float
数量时,我不知道该位模式对应于什么)。既然你提到虚假价值,你可能已经认识到了这一点。但这是一个常见错误(例如,如果您实际上尝试在每个float
位置初始化值为5的数组),那么我想我会指出它。
您的代码也有其他问题(如果您进行上述修复,则会发现,然后使用cuda-memcheck
运行代码)。要了解如何进行良好的并行缩减,我建议研究CUDA并行缩减sample code和presentation。出于性能原因,不建议平行减少全局内存。
为了完整起见,我发现了以下一些其他问题:
您的内核代码需要一个适当的__syncthreads()
语句,以确保在任何线程进入for循环的下一次迭代之前,块中所有线程的工作都已完成。
您对内核中的全局内存的最终写入也需要以读取位置为入口。否则,您始终启动额外块的策略将允许从此行读取超出范围(cuda-memcheck
将显示此内容。)
reduce
函数循环中的缩减逻辑通常搞砸了,需要以多种方式重新处理。
我不是说这段代码没有缺陷,但它似乎适用于给定的测试用例并产生正确的答案(1024):
#include <stdio.h>
/* -------- KERNEL -------- */
__global__ void reduce_kernel(float * d_out, float * d_in, const int size)
{
// position and threadId
int pos = blockIdx.x * blockDim.x + threadIdx.x;
int tid = threadIdx.x;
// do reduction in global memory
for (unsigned int s = blockDim.x / 2; s>0; s>>=1)
{
if (tid < s)
{
if (pos+s < size) // Handling out of bounds
{
d_in[pos] = d_in[pos] + d_in[pos+s];
}
}
__syncthreads();
}
// only thread 0 writes result, as thread
if ((tid==0) && (pos < size))
{
d_out[blockIdx.x] = d_in[pos];
}
}
/* -------- KERNEL WRAPPER -------- */
void reduce(float * d_out, float * d_in, int size, int num_threads)
{
// setting up blocks and intermediate result holder
int num_blocks = ((size) / num_threads) + 1;
float * d_intermediate;
cudaMalloc(&d_intermediate, sizeof(float)*num_blocks);
cudaMemset(d_intermediate, 0, sizeof(float)*num_blocks);
int prev_num_blocks;
// recursively solving, will run approximately log base num_threads times.
do
{
reduce_kernel<<<num_blocks, num_threads>>>(d_intermediate, d_in, size);
// updating input to intermediate
cudaMemcpy(d_in, d_intermediate, sizeof(float)*num_blocks, cudaMemcpyDeviceToDevice);
// Updating num_blocks to reflect how many blocks we now want to compute on
prev_num_blocks = num_blocks;
num_blocks = num_blocks / num_threads + 1;
// updating intermediate
cudaFree(d_intermediate);
cudaMalloc(&d_intermediate, sizeof(float)*num_blocks);
size = num_blocks*num_threads;
}
while(num_blocks > num_threads); // if it is too small, compute rest.
// computing rest
reduce_kernel<<<1, prev_num_blocks>>>(d_out, d_in, prev_num_blocks);
}
/* -------- MAIN -------- */
int main(int argc, char **argv)
{
// Setting num_threads
int num_threads = 512;
// Making non-bogus data and setting it on the GPU
const int size = 1024;
const int size_out = 1;
float * d_in;
float * d_out;
cudaMalloc(&d_in, sizeof(float)*size);
cudaMalloc((void**)&d_out, sizeof(float)*size_out);
//const int value = 5;
//cudaMemset(d_in, value, sizeof(float)*size);
float * h_in = (float *)malloc(size*sizeof(float));
for (int i = 0; i < size; i++) h_in[i] = 1.0f;
cudaMemcpy(d_in, h_in, sizeof(float)*size, cudaMemcpyHostToDevice);
// Running kernel wrapper
reduce(d_out, d_in, size, num_threads);
float result;
cudaMemcpy(&result, d_out, sizeof(float), cudaMemcpyDeviceToHost);
printf("sum is element is: %.f\n", result);
}