注释DICOM文件

Question

我正在寻找一个在Python内部或外部的应用程序，它允许我获取现有的DICOM文件，随后将一些标记添加到医学图像（例如彩色点），然后保存这些标记的坐标和最终形象。这是否可以在例如PyDicom还是其他程序？欢迎任何想法。

Answer 1

您永远不应该编辑现有的DICOM实例。简而言之，DICOM存储了一个名为Unique Instance UID的唯一标识符。这意味着如果您编辑文件，添加后模态覆盖，然后将其发送回PACS系统，它将被丢弃（按设计！）。

因此，通常的方法是创建另一个DICOM实例，在这种情况下，我会建议一个简单的Grayscale Softcopy Presentation State IOD，然后简单地引用现有的DICOM图像。您可以根据需要使用尽可能多的Grayscale Softcopy Presentation State实例，使其比现有DICOM实例的原始就地编辑更灵活。

Answer 2

让我延长@ malat的答案。

您可以使用pydicom库从头开始编写新的DICOM文件。在您的情况下，您需要查看Grayscale Softcopy Presentation State CIOD以及标记为＆＃34; M＆＃34;的每个模块。对于强制性，请填写标记为＆＃34; 1＆＃34;的所有属性。 （根据要求），或＆＃34; 1C＆＃34; （有条件要求）。你还应该填写任何标记的＆＃34; 2＆＃34;或＆＃34; 2C＆＃34; （如果已知则需要）。

您可以从正在注释的图像中复制许多DICOM标记。例如。 Type of Patient ID是必需的，并且是必填模块，因此您可以将其值从原始图像复制。

您将生成的大多数新数据将进入Overlay Plane模块。