我有很长的注释基因列表。它们以不同的级别“A”,“B”,“C”等注释。每个级别具有不同的名称,在某些情况下具有不同的格式。我想保持每个级别的名称完好无损。在R中,文本文档被导入为1列,我想将A,B,C和D行分成列。行是有序的,意味着“B Level2”列在应用程序A Level1类别之后和“C Level3”类别之上。 “#”从下一个A levell类别中分离出D级。 因此,在每个“#”之后,我想将A,B,C和D行分成不同的列。然后用上面的级别类别名称填写左侧的列。 给出这个例子df:
df <- data.frame(x = c("A<b>Level1</b>", "B", "B <b>Level2</b>", "C 02000 Level3 [BR:ko02000]", "C 02010 Level3 [PATH:ko02010]", "D Level4; K15551 tauA; taurine transport system substrate-binding protein", "D Level4; K15551 tauA; taurine transport system substrate-binding protein", "D Level4; K15551 tauA; taurine transport system substrate-binding protein"))
输出需要如下所示:
A B C D
A<b>Level1</b> B <b>Level2</b> C 02000 Level3 [BR:ko02000] NA
A<b>Level1</b> B <b>Level2</b> C 02010 Level3 [PATH:ko02010] D Level4; K15551 tauA; taurine transport system substrate-binding protein
A<b>Level1</b> B <b>Level2</b> C 02010 Level3 [PATH:ko02010] D Level4; K15551 tauA; taurine transport system substrate-binding protein
A<b>Level1</b> B <b>Level2</b> C 02010 Level3 [PATH:ko02010] D Level4; K15551 tauA; taurine transport system substrate-binding protein
到目前为止,我正在尝试使用dplyr和tidyr分隔()输入df,但我似乎无法让它工作。 建议?想法??
答案 0 :(得分:2)
我建议使用使用split
创建的数据框列表:
split(df, substr(df$x, 1, 1))
如果你真的必须拥有它如何展示它:
library(dplyr)
library(tidyr)
df %>% group_by(id = substr(x, 1, 1)) %>%
mutate(row = row_number()) %>%
spread(id, x) %>%
fill(-row)