将列分成多行并在R中填充到左侧

时间:2015-12-16 18:39:37

标签: r dplyr tidyr

我有很长的注释基因列表。它们以不同的级别“A”,“B”,“C”等注释。每个级别具有不同的名称,在某些情况下具有不同的格式。我想保持每个级别的名称完好无损。在R中,文本文档被导入为1列,我想将A,B,C和D行分成列。行是有序的,意味着“B Level2”列在应用程序A Level1类别之后和“C Level3”类别之上。 “#”从下一个A levell类别中分离出D级。 因此,在每个“#”之后,我想将A,B,C和D行分成不同的列。然后用上面的级别类别名称填写左侧的列。 给出这个例子df:

df <- data.frame(x = c("A<b>Level1</b>", "B", "B  <b>Level2</b>", "C    02000 Level3 [BR:ko02000]", "C    02010 Level3 [PATH:ko02010]", "D      Level4; K15551  tauA; taurine transport system substrate-binding protein", "D      Level4; K15551  tauA; taurine transport system substrate-binding protein", "D      Level4; K15551  tauA; taurine transport system substrate-binding protein"))

输出需要如下所示:

A   B   C   D
A<b>Level1</b>  B  <b>Level2</b>    C    02000 Level3 [BR:ko02000]  NA
A<b>Level1</b>  B  <b>Level2</b>    C    02010 Level3 [PATH:ko02010]    D      Level4; K15551  tauA; taurine transport system substrate-binding protein
A<b>Level1</b>  B  <b>Level2</b>    C    02010 Level3 [PATH:ko02010]    D      Level4; K15551  tauA; taurine transport system substrate-binding protein
A<b>Level1</b>  B  <b>Level2</b>    C    02010 Level3 [PATH:ko02010]    D      Level4; K15551  tauA; taurine transport system substrate-binding protein

到目前为止,我正在尝试使用dplyr和tidyr分隔()输入df,但我似乎无法让它工作。 建议?想法??

1 个答案:

答案 0 :(得分:2)

我建议使用使用split创建的数据框列表:

split(df, substr(df$x, 1, 1))

如果你真的必须拥有它如何展示它:

library(dplyr)
library(tidyr)
df %>% group_by(id = substr(x, 1, 1)) %>%
       mutate(row = row_number()) %>%
       spread(id, x) %>%
       fill(-row)