有一个相对简单的代码块,它循环遍历两个数组,相乘并累加:
su
有没有办法在没有迭代的情况下做到这一点?我想可以使用cumsum / cumprod,但我很难搞清楚如何使用。当你逐步分解发生的事情时,它看起来像这样:
import numpy as np
a = np.array([1, 2, 4, 6, 7, 8, 9, 11])
b = np.array([0.01, 0.2, 0.03, 0.1, 0.1, 0.6, 0.5, 0.9])
c = []
d = 0
for i, val in enumerate(a):
d += val
c.append(d)
d *= b[i]
编辑以澄清:我对列表(或数组)感兴趣 c 。
答案 0 :(得分:6)
在每次迭代中,你都有 -
d[n+1] = d[n] + a[n]
d[n+1] = d[n+1] * b[n]
因此,基本上 -
d[n+1] = (d[n] + a[n]) * b[n]
即。 -
d[n+1] = (d[n]* b[n]) + K[n] #where `K[n] = a[n] * b[n]`
现在,如果你记下直到n = 2
个案例的表达式,使用这个公式,你会有 -
d [1] = d [0] * b [0] + K [0]
d [2] = d [0] * b [0] * b [1] + K [0] * b [1] + K [1]
d [3] = d [0] * b [0] * b [1] * b [2] + K [0] * b [1] * b [2] + K [1] * b [ 2] + K [2]
Scalars : b[0]*b[1]*b[2] b[1]*b[2] b[2] 1
Coefficients : d[0] K[0] K[1] K[2]
因此,你需要b
的反向cumprod,用K
数组执行元素乘法。最后,要获得c
,请执行cumsum
,然后存储c
,然后再缩小b
,这样您就需要缩小cumsum
版本反转的b
cumprod。
最终实施将如下所示 -
# Get reversed cumprod of b and pad with `1` at the end
b_rev_cumprod = b[::-1].cumprod()[::-1]
B = np.hstack((b_rev_cumprod,1))
# Get K
K = a*b
# Append with 0 at the start, corresponding starting d
K_ext = np.hstack((0,K))
# Perform elementwsie multiplication and cumsum and scale down for final c
sums = (B*K_ext).cumsum()
c = sums[1:]/b_rev_cumprod
运行时测试并验证输出
功能定义 -
def original_approach(a,b):
c = []
d = 0
for i, val in enumerate(a):
d = d+val
c.append(d)
d = d*b[i]
return c
def vectorized_approach(a,b):
b_rev_cumprod = b[::-1].cumprod()[::-1]
B = np.hstack((b_rev_cumprod,1))
K = a*b
K_ext = np.hstack((0,K))
sums = (B*K_ext).cumsum()
return sums[1:]/b_rev_cumprod
运行时和验证
案例#1:OP示例案例
In [301]: # Inputs
...: a = np.array([1, 2, 4, 6, 7, 8, 9, 11])
...: b = np.array([0.01, 0.2, 0.03, 0.1, 0.1, 0.6, 0.5, 0.9])
...:
In [302]: original_approach(a,b)
Out[302]:
[1,
2.0099999999999998,
4.4020000000000001,
6.1320600000000001,
7.6132059999999999,
8.7613205999999995,
14.256792359999999,
18.128396179999999]
In [303]: vectorized_approach(a,b)
Out[303]:
array([ 1. , 2.01 , 4.402 , 6.13206 ,
7.613206 , 8.7613206 , 14.25679236, 18.12839618])
案例#2:大输入案例
In [304]: # Inputs
...: N = 1000
...: a = np.random.randint(0,100000,N)
...: b = np.random.rand(N)+0.1
...:
In [305]: np.allclose(original_approach(a,b),vectorized_approach(a,b))
Out[305]: True
In [306]: %timeit original_approach(a,b)
1000 loops, best of 3: 746 µs per loop
In [307]: %timeit vectorized_approach(a,b)
10000 loops, best of 3: 76.9 µs per loop
请注意,对于极其庞大的输入数组情况,如果b
元素是如此小的分数,由于累积运算,b_rev_cumprod
的初始数可能会出现zeros
结果在NaNs
的初始位置。
答案 1 :(得分:3)
让我们看看我们是否能够更快。我现在离开了纯粹的python世界,并表明这种纯粹的数字问题可以进一步优化。
这两名球员是@Divakar的快速矢量化版本:
def vectorized_approach(a,b):
b_rev_cumprod = b[::-1].cumprod()[::-1]
B = np.hstack((b_rev_cumprod,1))
K = a*b
K_ext = np.hstack((0,K))
sums = (B*K_ext).cumsum()
return sums[1:]/b_rev_cumprod
和cython版本:
%%cython
import numpy as np
def cython_approach(long[:] a, double[:] b):
cdef double d
cdef size_t i, n
n = a.shape[0]
cdef double[:] c = np.empty(n)
d = 0
for i in range(n):
d += a[i]
c[i] = d
d *= b[i]
return c
cython版本比矢量化版本快5倍:
%timeit vectorized_approach(a,b)
- > 10000 loops, best of 3: 43.4 µs per loop
%timeit cython_approach(a,b)
- > 100000 loops, best of 3: 7.7 µs per loop
cython版本的另一个优点是它更具可读性。
最大的缺点是你要离开纯python并根据你的用例编译扩展模块可能不适合你。
答案 2 :(得分:2)
这对我有用,并且是矢量化的
b_mat = np.tile(b,(b.size,1)).T
b_mat = np.vstack((np.ones(b.size),b_mat))
np.fill_diagonal(b_mat,1)
b_mat[np.triu_indices(b.size)]=1
b_prod_mat = np.cumprod(b_mat,axis=0)
b_prod_mat[np.triu_indices(b.size)] = 0
np.fill_diagonal(b_prod_mat,1)
c = np.dot(b_prod_mat,a)
c
# output
array([ 1. , 2.01 , 4.402, 6.132, 7.613, 8.761, 14.257,
18.128, 16.316])
我同意不容易看到最新情况。您的数组c
可以写为矩阵向量乘法b_prod_mat * a
,其中a
是您的数组,b_prod_mat
由b
的特定产品组成。所有重点基本上都是创建b_prod_mat
。
答案 3 :(得分:1)
我不确定这比for循环好,但这是一种方式:
contains
它的作用是像这样创建一个大矩阵extension SequenceType where Generator.Element : Equatable
:
a.dot([np.concatenate((np.zeros(i), (1, ), b[i:-1])) for i in range(len(b))])
然后,您只需将向量A
与矩阵1 b0 b0b1 b0b1b2 ... b0b1..bn-1
0 1 b1 b1b2 ... b1..bn-1
0 0 1 b2 ...
...
0 0 0 0 ... 1
相乘,即可获得预期结果。