Question

我正在Bash脚本中运行一个名为CNV-Seq的软件，但是我没有权限运行以下命令：

R CMD INSTALL cnv/

错误是

* installing to library '/share/apps/r/3.2.2/intel/lib64/R/library'
Error: ERROR: no permission to install to directory '/share/apps/r/3.2.2/intel/lib64/R/library'

如果未获得许可，我该如何解决此问题。

Answer 1

一种方法是创建执行R脚本的bash脚本。因此，R脚本将包含：

install.packages("package_name")

将其另存为xyz.r

并且bash脚本将包含：

R -f path_to/xyz.r

将其另存为abc。

像这样运行bash脚本：

bash abc

权限 - 使用bash-script在R中安装库时出错

1 个答案: