我正在尝试运行3dfim +来计算感兴趣区域的相关性图。我用3drefit -deoblique
取消了数据(功能和转换到相同功能空间的ROI掩码)(因为我收到有关数据倾斜的错误消息)。然而,当从应用于此功能的ROI掩模中提取时间序列时,去斜视的功能图像现在没有时间维度和1D文件,其中只有一个数字(884.727 [264体素] )。对于每个时间点,它不应该是此ROI中的平均体素强度列吗?所有卷都去了哪里?当我尝试运行3dfim +时收到以下错误:
矩阵错误:向量乘法的维度不兼容:0x0 X 1 **内存使用:块= 84字节= 621942标准错误:++ 3dfim +:AFNI版本= AFNI_2011_05_26_1457(2011年6月22日)[64位] ++已创作作者:B。Douglas Ward 3dfim + main返回代码:1接口Fim无法运行。
我尝试运行的命令是
3dfim+ -input /path/mcorr_001_brain_3drefit.nii.gz -ideal_file /path/mcorr_001_brain_3drefit_maskave.1D -out Correlation -bucket corr_map.nii.gz
我尝试运行相同但使用原始倾斜数据和标准的附加内容:
"警告:如果要对倾斜的dset执行空间变换,例如/path/roi_sphere_30_21_18_flirt.nii.gz,或者查看/组合不同倾角的体积,则应考虑运行:3dWarp -deoblique在同一会话中的此数据集和其他倾斜数据集上。 "
仍然存在"矩阵错误的错误:向量乘法的尺寸不兼容:0x0 X 1"因此,看起来脱气导致了这个问题!
有谁知道可能导致这个问题的原因是什么?
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使用3dinfo检查输入文件(mcorr_001_brain_3drefit.nii.gz),看它是否有时间轴(TR信息)。如果不是简单地用3drefit添加时间轴。