根据R中的混淆矩阵的结果计算精度,召回率和FScore

时间:2015-11-07 11:51:38

标签: r confusion-matrix precision-recall

我有以下混淆矩阵,现在我需要从中计算精度,召回和FScore,我该如何使用获得的值来做到这一点?     混淆矩阵和统计

      Reference
Prediction One Zero
      One   37   43
      Zero  19  131

               Accuracy : 0.7304          
                 95% CI : (0.6682, 0.7866)
    No Information Rate : 0.7565          
    P-Value [Acc > NIR] : 0.841087        

                  Kappa : 0.3611          
 Mcnemar's Test P-Value : 0.003489        

            Sensitivity : 0.6607          
            Specificity : 0.7529          
         Pos Pred Value : 0.4625          
         Neg Pred Value : 0.8733          
             Prevalence : 0.2435          
         Detection Rate : 0.1609          
   Detection Prevalence : 0.3478          
      Balanced Accuracy : 0.7068          

       'Positive' Class : One

我在其他用户的建议

之后使用了以下编辑过的代码
library(class)
library(e1071)
library(caret)
library(party)
library(nnet)
library(forecast)
pimad <- read.csv("C:/Users/USER/Desktop/AMAN/pimad.csv")
nrow(pimad)  
set.seed(9850)
gp<-runif(nrow(pimad))
pimad<-pimad[order(gp),]
idx <- createDataPartition(y = pimad$class, p = 0.7, list = FALSE)
train<-pimad[idx,]
test<-pimad[-idx,]
svmmodel<-svm(class~.,train,kernel="radial")
psvm<-predict(svmmodel,test)
table(psvm,test$class)
library(sos)
findFn("confusion matrix precision recall FScore")
df<-(confusionMatrix(test$class, psvm))
dim(df)
df[1,2]/sum(df[1,2:3])
df

2 个答案:

答案 0 :(得分:3)

您无需做任何其他事情,您已获得df中所有要求的措施。只需输入:

  

LS(DF)   [1]“byClass”“点”“模式”“整体”“积极”“表”

     

df $ byClass#这是我参与的另一个例子

现在所有参数包括敏感性,特异性,pos预测值,neg pred val,精确度,召回率,F1,患病率,检出率,检测流行率和平衡准确度等表

答案 1 :(得分:0)

嗯,这是对矩阵进行子集化的简单计算。

如果您的混淆矩阵被称为df,则使用公式herehere

df
  Prediction One Zero
1        One  37   43
2       Zero  19  131

# Precision: tp/(tp+fp):
df[1,1]/sum(df[1,1:2])
[1] 0.4625

# Recall: tp/(tp + fn):
df[1,1]/sum(df[1:2,1])
[1] 0.6607143

# F-Score: 2 * precision * recall /(precision + recall):
2 * 0.4625 * 0.6607143 / (0.4625 + 0.6607143)
[1] 0.5441177