与实际染色体相比,未置换的基因组支架是否独特?

时间:2015-10-16 21:56:34

标签: scaffold dna-sequence blat

我使用UCSC blat搜索马基因组序列。返回了三个结果,两个是未放置的支架,另一个是chr1。所有人都与我的查询有100%的身份(gagttcctagacagacaccaaatacaacgtgggaatacacaacctactggcctatgtgaaacacctgaaaggccagaatgaggaagccctgaagagcttgagagaagctgaagacttaatccaggaagaacatggtgaccaatcaggcat)。 我的问题是,马中有3个这个基因的拷贝,或者支架是否属于chr1?值得一提的是,小鼠只有一个基因拷贝。

1 个答案:

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答案结果证明,所有3个结果都是基因组中的独特位置。未放置的支架是正在研究的基因组中的序列,但尚未添加到参考基因组中。