更新1：

Question

我在某个时候安装了包packrat，也许曾经使用过一次，继续我的生活。

然而，尽管没有在几个月内加载它，但它对我的常规R使用仍然是一个麻烦。

看似随机，我在RStudio中的R会话将在某些操作中失败并出现错误，尤其是包安装。这是最新的错误消息（在运行parallel::makeCluster(parallel::detectCores())之后：

）

file(filename, "r", encoding = encoding)出错：无法打开   连接

通话：来源 - ＆gt;文件

另外：警告信息：

在   file(filename, "r", encoding = encoding)：无法打开文件   'packrat / init.R'：没有这样的文件或目录

执行暂停

我检查了.libPaths()上的所有文件夹，我甚至没有安装packrat。为什么R仍在尝试执行packrat操作？我怎么能阻止这个？

到目前为止，我的管道胶带解决方案是简单地关闭并重新打开RStudio，它就像包装安装问题的魅力一样。

但是，我似乎无法在{em>只有一个 makeCluster(detectCores())脚本中为.R解决这个问题。它在另一个项目的另一个脚本中完美地运行。

背景：

sessionInfo()
# R version 3.2.2 (2015-08-14)
# Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
# Running under: Ubuntu 14.04.2 LTS

# locale:
#  [1] LC_CTYPE=en_US.UTF-8          LC_NUMERIC=C                  LC_TIME=en_US.UTF-8          
#  [4] LC_COLLATE=en_US.UTF-8        LC_MONETARY=en_US.UTF-8       LC_MESSAGES=en_US.UTF-8      
#  [7] LC_PAPER=en_US.UTF-8          LC_NAME=en_US.UTF-8           LC_ADDRESS=en_US.UTF-8       
# [10] LC_TELEPHONE=en_US.UTF-8      LC_MEASUREMENT=en_US.UTF-8    LC_IDENTIFICATION=en_US.UTF-8

# attached base packages:
# [1] parallel  stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base     

# other attached packages:
#  [1] doParallel_1.0.8 iterators_1.0.7  foreach_1.4.2    geosphere_1.4-3  xlsx_0.5.7       xlsxjars_0.6.1  
#  [7] rJava_0.9-6      xtable_1.7-4     sandwich_2.3-3   texreg_1.35      maptools_0.8-36  sp_1.1-1        
# [13] ggmap_2.5.2      ggplot2_1.0.1    data.table_1.9.5

# loaded via a namespace (and not attached):
#  [1] Rcpp_0.11.6         plyr_1.8.3          tools_3.2.2         digest_0.6.8        gtable_0.1.2       
#  [6] lattice_0.20-33     png_0.1-7           mapproj_1.2-4       proto_0.3-10        stringr_1.0.0      
# [11] RgoogleMaps_1.2.0.7 maps_2.3-11         grid_3.2.2          jpeg_0.1-8          foreign_0.8-66     
# [16] RJSONIO_1.3-0       reshape2_1.4.1      magrittr_1.5        codetools_0.2-11    scales_0.2.5       
# [21] MASS_7.3-43         colorspace_1.2-6    stringi_0.5-9003    munsell_0.4.2       chron_2.3-47       
# [26] rjson_0.2.15        zoo_1.7-12

更新1：

安装packrat无效。在完成之前运行packrat::init()会导致错误;没有改变。

更新2：

我通过确定它是导致问题的工作目录来隔离问题。我正在使用的工作目录中的内容可能会导致问题？之前在此目录中运行packrat的某些残留文件？

Answer 1

通过@BondedDust的刺激进一步试验和错误我终于似乎已经解决了这个问题。之前尝试在我工作的特定工作目录中使用packrat似乎留下了一些痕迹，尽管后来卸载了packrat。

特别是packrat edits your local .Rprofile（归功于@zerweck和@snaut的原始信用），在该目录的R startup上为source() d。

如果您使用.Rprofile存储一些本地配置，则应编辑该文件并删除packrat行（或任何您无法识别的行）;否则，您应该删除该文件以将项目恢复为按预期工作。

Answer 2

检查您的HOME目录中是否存在意外的.Rprofile。

如果您尝试将HOME中的packrat :: init（）打包，Packrat可能会将其放在此处。

带有packrat的

install.package（）在运行时会查找.Rprofile。我观察到的行为使HOME .Rprofile优先于getwd（）一个，从而导致

cannot open file 'packrat/init.R': No such file or directory

packrat破坏R功能的麻烦

更新1：

更新2：

2 个答案: