根据fileA
中的模式从fileB
中选择子集的最佳方法是什么?
Ex下面:我想将fileB
与IsomIR
中的fileA
列匹配(本例中没有匹配项)。
的fileA
IsomIR 100 106 122 124 126 134 141
1 hsa-let-7a-3p_CTATACAATCTACTGTCTTTCT 0.5523442 0.03172328 0.36802914 0.4566302 1.4500921 1.29752724 -0.3449874
2 hsa-let-7a-5p_AGAGGTAGTAGGTTGTATAGT -0.1878607 -0.18780651 -0.05246163 -0.4256350 0.7401029 0.21164568 -0.9593107
3 hsa-let-7a-5p_AGAGGTAGTAGGTTGTATAGTT 0.2786761 1.26500857 0.25548324 1.1209635 0.3973024 1.20270323 -0.9247950
4 hsa-let-7a-5p_CGAGGTAGTAGGTTGTATAGT -0.3736628 -0.56529189 -0.07579734 -0.2856444 0.4427098 0.16931756 -0.9746290
5 hsa-let-7a-5p_CGAGGTAGTAGGTTGTATAGTT 0.2109184 1.30968772 0.17753460 1.0215007 0.5122301 1.24588266 -0.9321214
6 hsa-let-7a-5p_TGAGGTAGTAGGTTGTATAG -0.6084397 -0.38716052 0.22242122 -0.3468830 0.8116086 -0.06074317 -1.2598679
FILEB
[1] hsa-miR-21-5p_GTAGCTTATCAGACTGATGTTGAC hsa-miR-21-5p_TAGCTTATCAGACTGATGTTGACC
[3] hsa-miR-135b-5p_TATGGCTTTTCATTCCTATGTGAA hsa-miR-135b-5p_TATGGCTTTTCATTCCTATGTG
[5] hsa-miR-135b-5p_TATGGCTTTTCATTCCTATGTGA hsa-miR-195-5p_TAGCAGCACAGAAATATTGGAAA
我试过了:
> match(fileB,fileA)
[1] NA NA NA NA NA
答案 0 :(得分:1)
fileA[fileA$IsomIR %in% fileB,]
这会将列IsomIR
的内容与fileB
的内容进行匹配,并仅选择fileA
中匹配的行。