如何在bipartite包中使用plotweb2修复此错误？

Question

我尝试在二分图中使用plotweb2构建一个营养网络。 我有2个不同的定量邻接矩阵（一个链接级别1与2，另一个链接级别2与3）。

当我尝试使用plotweb2函数时问题就出现了。我得到了这个错误：

  

dummy [i]＆lt; - dummy [i] - lowfreq [（（names（lowfreq）== names（dummy [i]））]中的错误：     替换的长度为零

问题是什么？有什么建议可以解决吗？

我的代码是：

library(bipartite)

net1<-read.delim("net1.txt", row.names=1) net2<-read.delim("net2.txt", row.names=1)

plotweb2(net1,net2)

提前谢谢。

Answer 1

plotweb2使用矩阵而不是数据帧。尝试先将两个对象都转换为矩阵

    library(bipartite)
    net1<-read.delim("net1.txt", row.names=1) net2<-read.delim("net2.txt", row.names=1)

    net1 <- as.matrix(net1)
    net2 <- as.matrix(net2)

    plotweb2(net1,net2)