Question

我安装了XHProf，希望看到调用图可视化。我点击View Full Callgraph并首先收到以下信息：

无法执行cmd：“dot -Tpng”。 stderr：`sh：dot：command not found'

经过一些谷歌搜索后，我发现它是由未安装Graphviz引起的。然后我安装了它：

$ yum install graphviz

再次尝试。现在我收到以下错误消息：

无法执行cmd：“dot -Tpng”。 stderr：`错误：/ usr / lib64 / graphviz / config6是零大小或其他读错误。

错误：/ usr / lib64 / graphviz / config6为零大小或其他读取错误。

“dot”
没有布局引擎支持
也许需要运行“dot -c”（使用安装程序的权限）才能注册插件？

确实执行dot -c会导致错误：

$ dot -c
Error: /usr/lib64/graphviz/config6 is zero sized, or other read error.
Warning: Could not load "/usr/lib64/graphviz/libgvplugin_pango.so.6" - file not found
Warning: Could not load "/usr/lib64/graphviz/libgvplugin_xlib.so.6" - file not found
Segmentation fault

但文件libgvplugin_pango.so.6和libgvplugin_xlib.so.6位于/usr/lib64/graphviz/：

$ ls -l /usr/lib64/graphviz
total 724
...
lrwxrwxrwx 1 root root     26 May 19 13:58 libgvplugin_pango.so.6 -> libgvplugin_pango.so.6.0.0
-rwxr-xr-x 1 root root  22408 Sep 19  2012 libgvplugin_pango.so.6.0.0
lrwxrwxrwx 1 root root     25 May 19 13:58 libgvplugin_xlib.so.6 -> libgvplugin_xlib.so.6.0.0
-rwxr-xr-x 1 root root  15656 Sep 19  2012 libgvplugin_xlib.so.6.0.0

好吧，作为符号链接。但这应该不重要。无论如何，我也测试了这个案例：

mv /usr/lib64/graphviz/libgvplugin_pango.so.6 /usr/lib64/graphviz/libgvplugin_pango.so.6_DEACT
mv /usr/lib64/graphviz/libgvplugin_xlib.so.6 /usr/lib64/graphviz/libgvplugin_xlib.so.6_DEACT
cp /usr/lib64/graphviz/libgvplugin_pango.so.6.0.0 /usr/lib64/graphviz/libgvplugin_pango.so.6
cp /usr/lib64/graphviz/libgvplugin_xlib.so.6.0.0 /usr/lib64/graphviz/libgvplugin_xlib.so.6

没有效果，仍然是同样的错误。

这里的错误是什么？以及如何使其正常工作？

环境：使用CentOS 6作为访客系统的VirtualBox VM。

Answer 1

我终于搞定了。

简短回答：

我猜 yum update 或/和 ann-libs安装可能是决定性的一步（-s）。但这仅仅是一个假设，因此我描述了可能很重要的所有步骤（见下文）。

详细答案：

首先，我尝试使用相关软件包安装graphviz：

$ yum install 'graphviz*'

但安装不起作用：

Error: php56w-common conflicts with php-common-5.3.3-46.el6_6.x86_64
 You could try using --skip-broken to work around the problem
** Found 1 pre-existing rpmdb problem(s), 'yum check' output follows:
cairo-1.8.8-3.1.el6.x86_64 has missing requires of libpixman-1.so.0()(64bit)

然后我尝试了同样的方法，但之前将graphviz-rhel.repo添加到了存储库：

$ cd /etc/yum.repos.d/
$ wget http://www.graphviz.org/graphviz-rhel.repo
$ yum list available 'graphviz*'
$ yum install 'graphviz*'

失败了另一个错误：

Error: Package: graphviz-2.38.0-1.el6.x86_64 (graphviz-stable)
           Requires: libANN.so.1()(64bit)
 You could try using --skip-broken to work around the problem
** Found 1 pre-existing rpmdb problem(s), 'yum check' output follows:
cairo-1.8.8-3.1.el6.x86_64 has missing requires of libpixman-1.so.0()(64bit)

正如预期的那样，--skip-broken也没有取得成功。

之后我做了多件事：yum clean all，yum erase 'graphviz*'，ann-libs安装和yum update：

$ yum clean all
$ yum install 'graphviz*'
$ yum erase 'graphviz*'
$ cd ~/temp/
$ wget http://dl.fedoraproject.org/pub/epel/6/x86_64/ann-libs-1.1.1-4.el6.x86_64.rpm
$ rpm -i ann-libs-1.1.1-4.el6.x86_64.rpm 
$ yum update

现在可行。

Answer 2

在某些RHEL 6系统上遇到同样的问题，结果问题是某些X11库上的Graphviz插件的隐藏依赖关系，我可以通过安装以下rpms来安装它：

libXau
libxcb
libXext

所以，这解决了我的问题：yum install gtk2 libXau libxcb libXext

获得XHProf可视化（Graphviz和dot的问题）工作

2 个答案: