如何在TraMineR

Question

我有很长的数据集，我想尝试seqefsub（）函数的不同设置，并且根据设置，一次运行可能需要相对较长的时间。因此，我希望计算机计算所有不同的变化，然后评估结果，evtl。用它们进行进一步处理。

我的问题是当我将结果保存到文件中并加载它们时，数据的结构似乎被打破了。因此，在加载后，我无法在此数据上使用TraMineR函数，因此我需要在关闭R后每次重现所有计算。

使用RStudio（.RData）保存到工作区会产生相同的错误。保存为二进制格式会产生相同的错误。

在保存之前，这是RStudio中序列列表的样子：

加载后：

这是我用于此示例的代码：

library(TraMineR)
data(actcal.tse)
seqe <- seqecreate(actcal.tse[1:100, ])
fsub <- seqefsub(seqe, minSupport = 0.1)
save(fsub, file="fsub.rda")
rm(fsub)
load("fsub.rda")

我的系统详情：

• x86_64-pc-linux-gnu（Ubuntu 14.04 LTE）
• R版本3.2.0（2015-04-16）
• RStudio版本0.98.1103
• TraMineR稳定版1.8-9（建于：2015-04-22）

Answer 1

如果check从seqefsub（）返回的值，则它是一个subseqelist对象。此类对象包含文档中列出的其他对象：

  

seqe ：搜索子序列的序列列表（seqelist事件序列对象）。

     

subseq ：子序列列表（seqelist事件序列对象）。

     

数据：包含有关子序列的详细信息（支持，频率等）的数据框

等等。我保存结果的方法是将我需要的数据转换为列表，并在保存之前用它们构建数据框。

library(TraMineR)
data(actcal.tse)
seqe <- seqecreate(actcal.tse[1:100, ])
fsub <- seqefsub(seqe, minSupport = 0.1)

#Get the data I need only 
#(Explore the other objects to get what you need)====
#Gets the column support from data (which is a data frame)
support <- fsub$data$Support

#subseq is class that cannot be converted to a data frame 
#it stores de subsquences found and I will convert them to strings
sequences <- as.character(fsub$subseq) 

#Builds the data frame
result <- data.frame(sequences, support)

#Save it at root
save(result, file="~/result.rda")

rm(result)

load('~/result.rda')

我希望它仍能帮助你。