lm()中的poly():原始与正交之间的差异

时间:2015-05-02 08:04:24

标签: r

我有

library(ISLR)
attach(Wage)

# Polynomial Regression and Step Functions

fit=lm(wage~poly(age,4),data=Wage)
coef(summary(fit))

fit2=lm(wage~poly(age,4,raw=T),data=Wage)
coef(summary(fit2))

plot(age, wage)
lines(20:350, predict(fit, newdata = data.frame(age=20:350)), lwd=3, col="darkred")
lines(20:350, predict(fit2, newdata = data.frame(age=20:350)), lwd=3, col="darkred")

预测线看起来是一样的,但为什么系数如此不同?你如何在raw=Traw=F中解释它们。

我发现poly(...,raw=T)生成的系数与~age+I(age^2)+I(age^3)+I(age^4)生成的系数匹配。

如果我想使用系数来预测"手动" (不使用predict()函数)有什么我应该注意的吗?我应该如何解释poly()中正交多项式的系数。

2 个答案:

答案 0 :(得分:51)

默认情况下,使用raw = FALSEpoly()计算正交多项式。它在内部使用原始编码x,x ^ 2,x ^ 3,......建立模型矩阵,然后对列进行缩放,使每列与前一列正交。这不会改变拟合值,但具有以下优点:您可以查看多项式中的某个顺序是否显着改善了较低阶的回归。

考虑简单的cars数据,其中包含响应停止dist和驾驶speed。在物理上,这应该具有二次关系,但在这个(旧的)数据集中,二次项并不重要:

m1 <- lm(dist ~ poly(speed, 2), data = cars)
m2 <- lm(dist ~ poly(speed, 2, raw = TRUE), data = cars)

在正交编码中,您可以在summary(m1)中获得以下系数:

                Estimate Std. Error t value Pr(>|t|)    
(Intercept)       42.980      2.146  20.026  < 2e-16 ***
poly(speed, 2)1  145.552     15.176   9.591 1.21e-12 ***
poly(speed, 2)2   22.996     15.176   1.515    0.136    

这表明存在非常显着的线性效应,而第二顺序不显着。后一个p值(即多项式中最高阶之一)与原始编码中的相同:

                            Estimate Std. Error t value Pr(>|t|)
(Intercept)                  2.47014   14.81716   0.167    0.868
poly(speed, 2, raw = TRUE)1  0.91329    2.03422   0.449    0.656
poly(speed, 2, raw = TRUE)2  0.09996    0.06597   1.515    0.136

但是低阶p值发生了显着变化。原因是在模型m1中,回归量是正交的,而它们在m2中高度相关:

cor(model.matrix(m1)[, 2], model.matrix(m1)[, 3])
## [1] 4.686464e-17
cor(model.matrix(m2)[, 2], model.matrix(m2)[, 3])
## [1] 0.9794765

因此,在原始编码中,如果speed保留在模型中,则只能解释speed^2的p值。由于两个回归量都是高度相关的,因此其中一个可以被丢弃。然而,在正交编码中speed^2仅捕获未被线性项捕获的二次部分。然后很明显,线性部分是显着的,而二次部分没有其他意义。

答案 1 :(得分:1)

我相信基于raw=T运行多项式回归的方法是,人们会根据该系数的pvalue来查看最高幂项并评估其重要性。

如果发现不显着(大pvalue)那么回归将在没有特定的非显着功率(即下一个较低程度)的情况下重新运行,并且这将一次一步地执行如果不重要

如果在任何时候更高的程度是重要的,那么该过程将停止并断言,该程度是合适的。