我的回答是一个分类变量(一些字母表),因此我在制作模型时使用了='multinomial',现在我想预测响应并根据这些字母表获得输出,而不是概率矩阵
但是在predict(model, newdata, type='response')
中,它会提供概率,与type='link'
的结果相同。
有没有办法获得分类输出?
BST = gbm(V1~.,data=training,distribution='multinomial',n.trees=2000,interaction.depth=4,cv.folds=5,shrinkage=0.005)
predBST = predict(BST,newdata=test,type='response')
答案 0 :(得分:29)
在predict.gbm
文档中,提到了:
如果type ="响应"然后gbm转换回与相同的比例 结果。目前唯一的影响就是返回 伯努利的概率和泊松的预期计数。为了 其他发行版"响应"和"链接"返回相同的。
正如Dominic建议的那样,你应该做的是从结果predBST
矩阵中选择具有最高概率的响应,方法是对预测的矢量输出执行apply(.., 1, which.max)
。
以下是包含iris
数据集的代码示例:
library(gbm)
data(iris)
df <- iris[,-c(1)] # remove index
df <- df[sample(nrow(df)),] # shuffle
df.train <- df[1:100,]
df.test <- df[101:150,]
BST = gbm(Species~.,data=df.train,
distribution='multinomial',
n.trees=200,
interaction.depth=4,
#cv.folds=5,
shrinkage=0.005)
predBST = predict(BST,n.trees=200, newdata=df.test,type='response')
p.predBST <- apply(predBST, 1, which.max)
> predBST[1:6,,]
setosa versicolor virginica
[1,] 0.89010862 0.05501921 0.05487217
[2,] 0.09370400 0.45616148 0.45013452
[3,] 0.05476228 0.05968445 0.88555327
[4,] 0.05452803 0.06006513 0.88540684
[5,] 0.05393377 0.06735331 0.87871292
[6,] 0.05416855 0.06548646 0.88034499
> head(p.predBST)
[1] 1 2 3 3 3 3